ইথিওপিয়াতে SARS-CoV-2 শনাক্ত করতে চারটি নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন অ্যাসেসের কর্মক্ষমতা

Nature.com পরিদর্শন করার জন্য আপনাকে ধন্যবাদ.আপনি সীমিত CSS সমর্থন সহ একটি ব্রাউজার সংস্করণ ব্যবহার করছেন।সেরা অভিজ্ঞতার জন্য, আমরা আপনাকে একটি আপডেট করা ব্রাউজার ব্যবহার করার পরামর্শ দিই (অথবা ইন্টারনেট এক্সপ্লোরারে সামঞ্জস্য মোড অক্ষম করুন)৷উপরন্তু, চলমান সমর্থন নিশ্চিত করার জন্য, আমরা স্টাইল এবং জাভাস্ক্রিপ্ট ছাড়া সাইট দেখাই।
একবারে তিনটি স্লাইডের একটি ক্যারোজেল প্রদর্শন করে৷একবারে তিনটি স্লাইডের মধ্য দিয়ে যেতে পূর্ববর্তী এবং পরবর্তী বোতামগুলি ব্যবহার করুন, অথবা একটি সময়ে তিনটি স্লাইডের মধ্য দিয়ে যেতে শেষে স্লাইডার বোতামগুলি ব্যবহার করুন৷
2019 করোনভাইরাস ডিজিজ (COVID-19) প্রাদুর্ভাবের পর থেকে, অনেক বাণিজ্যিক নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন পরীক্ষা (NAATs) বিশ্বজুড়ে তৈরি করা হয়েছে এবং স্ট্যান্ডার্ড অ্যাসে পরিণত হয়েছে।যদিও বেশ কয়েকটি পরীক্ষা দ্রুত বিকশিত হয়েছিল এবং ল্যাবরেটরি ডায়াগনস্টিক পরীক্ষাগুলিতে প্রয়োগ করা হয়েছিল, এই পরীক্ষার কার্যকারিতা বিভিন্ন সেটিংসে মূল্যায়ন করা হয়নি।তাই, কম্পোজিট রেফারেন্স স্ট্যান্ডার্ড (CRS) ব্যবহার করে অ্যাবট SARS-CoV-2, দান জিন, বিজিআই এবং সানসুর বায়োটেক অ্যাসেসের কর্মক্ষমতা মূল্যায়ন করা এই গবেষণার লক্ষ্য।গবেষণাটি ইথিওপিয়ান পাবলিক হেলথ ইনস্টিটিউটে (EPHI) 1 থেকে 30 ডিসেম্বর 2020 পর্যন্ত পরিচালিত হয়েছিল। QIAamp RNA মিনি কিট এবং অ্যাবট ডিএনএ নমুনা প্রস্তুতি পদ্ধতি ব্যবহার করে 164টি নাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা বের করা হয়েছিল।164টি নমুনার মধ্যে, 59.1% ইতিবাচক এবং 40.9% সিআরএস-এর জন্য নেতিবাচক। CRS (p <0.05) এর তুলনায় Sansure Biotech ইতিবাচকতা উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল। CRS (p <0.05) এর তুলনায় Sansure Biotech ইতিবাচকতা উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল। Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p < 0,05)। Sansure Biotech এর ইতিবাচক ফলাফল CRS (p <0.05) এর তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল।与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低(p <0.05)।与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低(p <0.05)। У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05)। CRS (p <0.05) এর তুলনায় Sansure Biotech-এর উল্লেখযোগ্যভাবে কম ইতিবাচক ফলাফল ছিল।CRS-এর তুলনায় চারটি বিশ্লেষণের সামগ্রিক চুক্তি ছিল 96.3-100%।সানসুর বায়োটেক অ্যাসের কম ইতিবাচকতার হার ছাড়াও, চারটি অ্যাসের কর্মক্ষমতা প্রায় তুলনীয় ছিল।যেমন, Sansure বায়োটেক [রিসার্চ অনলি (RUO)] অ্যাসে ইথিওপিয়াতে এর ব্যবহারের জন্য অতিরিক্ত বৈধতা প্রয়োজন।অবশেষে, উপযুক্ত প্রস্তুতকারকের দাবির সাথে অ্যাসেস মূল্যায়ন করার জন্য অতিরিক্ত গবেষণা বিবেচনা করা উচিত।
ল্যাবরেটরি টেস্টিং হল বিশ্ব স্বাস্থ্য সংস্থার (WHO) কৌশলগত পরিকল্পনা ফর করোনাভাইরাস ডিজিজ 2019 (COVID-19) প্রস্তুতি এবং প্রতিক্রিয়া (SPRP)-এর অংশ।WHO পরামর্শ দেয় যে দেশগুলিকে প্রস্তুতি, সঠিক কেস ম্যানেজমেন্ট, সতর্কতা এবং জনস্বাস্থ্য চ্যালেঞ্জের দ্রুত প্রতিক্রিয়া উন্নত করার জন্য ল্যাবরেটরি সক্ষমতা তৈরি করতে হবে।এটি পরামর্শ দেয় যে উদীয়মান সংক্রামক এজেন্টদের রোগ এবং মহামারীবিদ্যার বৈশিষ্ট্য এবং তাদের বিস্তার নিয়ন্ত্রণে পরীক্ষাগারের ভূমিকা গুরুত্বপূর্ণ।
COVID-19 নির্ণয়ের জন্য মহামারী সংক্রান্ত এবং চিকিৎসা সংক্রান্ত তথ্য, ব্যক্তিগত উপসর্গ/লক্ষণ এবং রেডিওগ্রাফিক এবং ল্যাবরেটরি ডেটার প্রয়োজন।চীনের উহানে COVID-19 প্রাদুর্ভাবের রিপোর্ট হওয়ার পর থেকে, বিশ্বজুড়ে অনেক বাণিজ্যিক নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন পরীক্ষা (NAATs) তৈরি করা হয়েছে।রিয়েল-টাইম রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (rRT-PCR) গুরুতর তীব্র শ্বাসযন্ত্রের সিন্ড্রোম 2 (SARS-CoV-2)3 সংক্রমণের পরীক্ষাগার নির্ণয়ের জন্য একটি রুটিন এবং আদর্শ পদ্ধতি হিসাবে ব্যবহৃত হয়েছে।SARS-CoV-2-এর আণবিক সনাক্তকরণ সাধারণত ORF1a/b (ওপেন রিডিং ফ্রেম 1a/b) তে N (নিউক্লিওক্যাপসিড প্রোটিন জিন), E (এনভেলপ প্রোটিন জিন), এবং RdRp (RNA-নির্ভর RNA পলিমারেজ জিন) জিনের উপর ভিত্তি করে। .জিন) ভাইরাল জিনোম থেকে চিহ্নিত অঞ্চল।এগুলি ভাইরাস সনাক্তকরণের জন্য ভাইরাল জিনোমে পাওয়া প্রধান সংরক্ষিত অঞ্চল হিসাবে বিবেচিত হয়।এই জিনগুলির মধ্যে, RdRp এবং E জিনের উচ্চ বিশ্লেষণাত্মক সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা রয়েছে, যখন N জিনের বিশ্লেষণাত্মক সংবেদনশীলতা কম।
পিসিআর অ্যাসেসের কার্যকারিতা বিভিন্ন কারণের উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত হতে পারে যেমন: নিষ্কাশন বিকারক, পরিবর্ধন/সনাক্তকরণ বিকারক, নিষ্কাশন পদ্ধতি, পিসিআর মেশিনের গুণমান এবং অন্যান্য যন্ত্র।এপ্রিল 2020 পর্যন্ত, নয়টি দেশের 48টিরও বেশি বিভিন্ন ডায়াগনস্টিক ডিভাইস COVID-196 ডায়াগনস্টিকসের জন্য জরুরি ব্যবহারের অনুমোদন (EUA) পেয়েছে।ইথিওপিয়াতে, ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 এবং Quant-studio7 সহ 26টি জনস্বাস্থ্য প্রতিষ্ঠানে SARS-CoV-2-এর PCR সনাক্তকরণের জন্য 14টিরও বেশি রিয়েল-টাইম PCR প্ল্যাটফর্ম ব্যবহার করা হয়।এছাড়াও, বিভিন্ন PCR পরীক্ষার কিট পাওয়া যায়, যেমন দান জিন পরীক্ষা, অ্যাবট SARS-CoV-2 পরীক্ষা, Sansure Biotech পরীক্ষা এবং SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা।যদিও rRT-PCR অত্যন্ত সংবেদনশীল, কোভিড-১৯-এর কিছু রোগী ভুল সংগ্রহ, পরিবহন, স্টোরেজ এবং হ্যান্ডলিং এবং পরীক্ষাগার পরীক্ষার কারণে নমুনায় ভাইরাল রাইবোনিউক্লিক অ্যাসিড (RNA) এর অপর্যাপ্ত কপির কারণে মিথ্যা নেতিবাচক ফলাফলের রিপোর্ট করে।কর্মীদের শর্ত এবং কর্ম8.এছাড়াও, নমুনা বা নিয়ন্ত্রণের ভুল ব্যবস্থাপনা, সাইকেল থ্রেশহোল্ড (Ct) সেটিং এবং অন্যান্য প্যাথোজেনিক নিউক্লিক অ্যাসিড বা নিষ্ক্রিয়/অবশিষ্ট SARS-CoV-2 RNA এর সাথে ক্রস-রিঅ্যাকটিভিটি rRT-PCR9 অ্যাসেসে মিথ্যা ইতিবাচক ফলাফলের দিকে নিয়ে যেতে পারে।সুতরাং, এটা স্পষ্ট যে পিসিআর পরীক্ষাগুলি প্রকৃতপক্ষে জিনের টুকরোগুলির বাহককে সনাক্ত করতে পারে, কারণ তারা সত্যিকারের সক্রিয় ভাইরাল জিনের মধ্যে পার্থক্য করতে পারে না, তাই পরীক্ষাগুলি শুধুমাত্র বাহক সনাক্ত করতে পারে এবং রোগীদের নয়।অতএব, আমাদের সেটিংসে মানক পদ্ধতি ব্যবহার করে ডায়াগনস্টিক কর্মক্ষমতা মূল্যায়ন করা গুরুত্বপূর্ণ।যদিও অনেক NAAT রিএজেন্ট ইথিওপিয়ান পাবলিক হেলথ ইন্সটিটিউট (EPHI) এবং সারা দেশে পাওয়া যায়, তবুও তাদের কার্যকারিতার তুলনামূলক কোনো মূল্যায়ন এখনও রিপোর্ট করা হয়নি।অতএব, এই গবেষণার লক্ষ্য ছিল ক্লিনিকাল নমুনা ব্যবহার করে rRT-PCR দ্বারা SARS-CoV-2 সনাক্তকরণের জন্য বাণিজ্যিকভাবে উপলব্ধ কিটগুলির তুলনামূলক কর্মক্ষমতা মূল্যায়ন করা।
সন্দেহভাজন COVID-19 সহ মোট 164 জন অংশগ্রহণকারীকে এই গবেষণায় অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল।বেশিরভাগ নমুনা চিকিত্সা কেন্দ্র থেকে ছিল (118/164 = 72%), বাকি 46 (28%) অংশগ্রহণকারীরা অ-চিকিত্সা কেন্দ্র থেকে ছিল।কেন্দ্রে চিকিত্সা করা হয়নি এমন অংশগ্রহণকারীদের মধ্যে, 15 (9.1%) ক্লিনিক্যালি সন্দেহভাজন কেস এবং 31 (18.9%) নিশ্চিত হওয়া মামলার পরিচিতি ছিল।নিরানব্বই (56.7%) অংশগ্রহণকারীরা পুরুষ ছিলেন এবং অংশগ্রহণকারীদের গড় (± SD) বয়স ছিল 31.10 (± 11.82) বছর।
এই গবেষণায়, COVID-19 এর জন্য চারটি পরীক্ষার ইতিবাচক এবং নেতিবাচক হার নির্ধারণ করা হয়েছিল।এইভাবে, অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাস, Daan Gene 2019-nCoV অ্যাস, SARS-CoV-2 BGI অ্যাস এবং সানসুর বায়োটেক 2019-nCoV অ্যাস এর ইতিবাচক হার ছিল যথাক্রমে 59.1%, 58.5%, 57.9% এবং 57.9% .ইতিবাচক এবং নেতিবাচক যৌগিক রেফারেন্স স্ট্যান্ডার্ড (CRS) স্কোর ছিল যথাক্রমে 97 (59.1%) এবং 67 (40.9%), (সারণী 1)।এই সমীক্ষায়, CRS-এর সংজ্ঞাটি "যেকোনো ইতিবাচক" নিয়মের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছিল, যেখানে চারটি পরীক্ষার ফলাফলের মধ্যে, একই ফলাফল প্রদানকারী দুই বা ততোধিক পরীক্ষার ফলাফল সত্য ইতিবাচক বা নেতিবাচক বলে বিবেচিত হয়েছিল।
এই সমীক্ষায়, আমরা CRS-এর তুলনায় সমস্ত বিশ্লেষণের জন্য 100% (95% CI 94.6–100) একটি নেতিবাচক শতাংশ চুক্তি (NPA) পেয়েছি।Sansure বায়োটেকনোলজি বিশ্লেষণে 93.8% (95% CI 87.2-97.1) একটি ন্যূনতম PPA দেখানো হয়েছে এবং Daan Gene 2019-nCoV বিশ্লেষণে 99.4% (95% CI 96.6-99.9) সামগ্রিক চুক্তি ছিল।বিপরীতে, SARS-CoV-2 BGI অ্যাস এবং Sansure Biotech 2019-nCoV অ্যাস এর মধ্যে সামগ্রিক চুক্তি ছিল যথাক্রমে 98.8% এবং 96.3% (সারণী 2)।
CRS এবং Abbott SARS-CoV-2 পরীক্ষার ফলাফলের মধ্যে চুক্তির কোহেনের কাপ্পা সহগ সম্পূর্ণরূপে সামঞ্জস্যপূর্ণ ছিল (K = 1.00)।একইভাবে, Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, এবং Sansure Biotech 2019-nCoV দ্বারা সনাক্ত করা কোহেনের কাপা মানগুলিও CRS (K ≥ 0.925) এর সাথে সম্পূর্ণ সামঞ্জস্যপূর্ণ।এই তুলনামূলক বিশ্লেষণে, চি-স্কোয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) দেখায় যে Sansure Biotech 2019-nCoV পরীক্ষার ফলাফলগুলি CRS ফলাফল (p = 0.031) (টেবিল 2) থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা ছিল।
চিত্রে দেখানো হয়েছে।1 অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাসে (সম্মিলিত RdRp এবং N জিন) এর সর্বনিম্ন Ct মানের (< 20 Ct) শতাংশ ছিল 87.6% এবং Sansure Biotech 2019-nCoV অ্যাসের ORF1a/b জিন Ct মান দেখিয়েছে যে শতাংশ কম Ct মান (<20 Ct) ছিল 50.3% এবং উচ্চ Ct মান (36–40 Ct) ছিল 3.2%। 1 অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাসে (সম্মিলিত RdRp এবং N জিন) এর সর্বনিম্ন Ct মানের (< 20 Ct) শতাংশ ছিল 87.6% এবং Sansure Biotech 2019-nCoV অ্যাসের ORF1a/b জিন Ct মান দেখিয়েছে যে শতাংশ কম Ct মান (<20 Ct) ছিল 50.3% এবং উচ্চ Ct মান (36–40 Ct) ছিল 3.2%।চিত্রে দেখানো হয়েছে।1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) анализа Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) составил 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял 50,3%, а высокое значение Ct (36–40 Ct) составляло 3,2%। 1, অ্যাবট SARS-CoV-2 (সম্মিলিত জিন RdRp এবং N) এর সর্বনিম্ন Ct মান (<20 Ct) বিশ্লেষণের শতাংশ ছিল 87.6%, এবং Sansure Biotech 2019-nCoV-এর ORF1a/b জিন বিশ্লেষণের Ct মান দেখানো হয়েছে যে কম Ct মানের শতাংশ (<20 Ct) 50.3%, এবং উচ্চ মানের Ct (36–40 Ct) 3.2%।如 图 1 所 示 , অ্যাবট সারস-কোভ -2 检测 (结合 rdrp 和 n 基因) 的 的 低 低 Ct 值 百分比 (<20 সিটি) 为 87.6%, স্যানসুর বায়োটেক 2019-এনসিওভি 检测 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的 的值(<20 Ct) 的百分比为50.3%,高Ct 值(36–40 Ct) 的百分比为3.2%। চিত্র 1-এ দেখানো হয়েছে, অ্যাবট SARS-CoV-2 পরীক্ষার সর্বনিম্ন Ct মান শতাংশ (<20 Ct) হল 87.6%, Sansure Biotech 2019-nCoV পরীক্ষার ORF1a/b জিনের Ct মান দেখায় কম Ct值(<20 Ct) % শতাংশ হল 50.3%, 高Ct 值(36–40 Ct) শতাংশ হল 3.2%৷ Как показано на рисунке 1, анализ Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое низкое процентное значение Ct (< 20 Ct) в размере 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b в исследовании Sansure Biotech 2019 - অ্যানালিজ nCoV показал низкий Ct. চিত্র 1-এ দেখানো হিসাবে, অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাস (RdRp এবং N জিনের সমন্বয়ে) সর্বনিম্ন শতাংশ Ct মান (<20 Ct) ছিল 87.6%, যেখানে Sansure-এ ORF1a/b জিনের Ct মান ছিল বায়োটেক 2019 অধ্যয়ন – nCoV-এর বিশ্লেষণে কম Ct দেখানো হয়েছে। Процент значений (<20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) составил 3,2%। মানগুলির শতাংশ (<20 Ct) ছিল 50.3%, এবং উচ্চ Ct মানগুলির শতাংশ (36–40 Ct) ছিল 3.2%।অ্যাবট SARS-CoV-2 B পরীক্ষা 30 এর উপরে Ct মান রেকর্ড করেছে। অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 অ্যাসে ORF1a/b জিনের উচ্চ Ct মান (> 36 Ct) শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)। অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 অ্যাসে ORF1a/b জিনের উচ্চ Ct মান (> 36 Ct) শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)। С другой стороны, BGI SARS-CoV-2 gen ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составля (%41рис). অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 জিন ORF1a/b-এর বিশ্লেষণে উচ্চ Ct মান (> 36 Ct) ছিল, যার শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)।另一方面,BGI SARS-CoV-2 检测中,ORF1a/b 基因具有高Ct 值(> 36 Ct)的百分比为4%(弉。 অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 সনাক্তকরণে, উচ্চ Ct মান (>36 Ct) সহ ORF1a/b জিনের শতাংশ হল 4% (চিত্র 1)। С другой стороны, BGI SARS-CoV-2 PROcent genov ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (ris.1). অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 বিশ্লেষণে, উচ্চ Ct মান (>36 Ct) সহ ORF1a/b জিনের শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)।
এই গবেষণায়, আমরা 164টি নাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা নিয়েছি।সমস্ত ধরণের অ্যাসেসের জন্য, সংশ্লিষ্ট নির্মাতাদের দ্বারা প্রস্তাবিত পদ্ধতি এবং কিটগুলি ব্যবহার করে আরএনএ বিচ্ছিন্নকরণ এবং পরিবর্ধন করা হয়েছিল।
এই সমীক্ষাটি প্রমাণ করেছে যে SARS-CoV-2-এর জন্য অ্যাবটের পরীক্ষায় 100% ইতিবাচক, নেতিবাচক এবং সামগ্রিক সমন্বয় সহ CRS-এর মতোই সনাক্তকরণ কার্যক্ষমতা রয়েছে।কোহেনের কাপ্পা চুক্তি হল 1.00, যা CRS-এর সাথে সম্পূর্ণ চুক্তি নির্দেশ করে৷মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের ওয়াশিংটন বিশ্ববিদ্যালয়ের অনুরূপ একটি সমীক্ষায় দেখা গেছে যে SARS-CoV-2 এর জন্য অ্যাবট পরীক্ষার সামগ্রিক সংবেদনশীলতা এবং নির্দিষ্টতা ছিল যথাক্রমে 93% এবং 100%, CDC-এর পরীক্ষাগার-নির্ধারিত অ্যাস (LDA) এর তুলনায়। .11. অ্যাবট SARS-CoV-2 সনাক্তকরণ সিস্টেমটি N এবং RdRp জিনগুলির একযোগে সম্মিলিত সনাক্তকরণের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে, কারণ উভয় জিনই বেশি সংবেদনশীল, মিথ্যা নেতিবাচক 12 কমিয়ে দেয়।ভিয়েনা, অস্ট্রিয়ার একটি গবেষণায় আরও দেখা গেছে যে বৃহৎ নিষ্কাশন নমুনা ভলিউম এবং সনাক্তকরণ ইলুয়েন্ট ভলিউম তরল প্রভাব কমিয়েছে এবং সনাক্তকরণের দক্ষতা বৃদ্ধি করেছে13।এইভাবে, SARS-CoV-2 অ্যাসের জন্য অ্যাবটের নিখুঁত মিলটি একটি প্ল্যাটফর্ম সনাক্তকরণ সিস্টেমের সাথে যুক্ত হতে পারে যা একই সাথে সংমিশ্রণকারী জিন সনাক্ত করে, প্রচুর সংখ্যক নমুনা (0.5 মিলি) বের করে এবং প্রচুর পরিমাণে ইলুয়েন্ট (40 μl) ব্যবহার করে।
আমাদের ফলাফলগুলিও দেখিয়েছে যে দান জেনেটিক পরীক্ষার সনাক্তকরণ কার্যকারিতা প্রায় সিআরএস-এর মতোই ছিল।এটি হুয়াইনান, চীনের আনহুই বিশ্ববিদ্যালয়ে পরিচালিত একটি গবেষণা14 এবং প্রস্তুতকারকের 100% ইতিবাচক চুক্তির দাবির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ।সামঞ্জস্যপূর্ণ ফলাফলের প্রতিবেদন সত্ত্বেও, একই ইলুয়েট পুনরায় পরীক্ষা করার পরে একটি নমুনা মিথ্যা নেতিবাচক ছিল, তবে অ্যাবট SARS-CoV-2 এবং Sansure Biotech nCoV-2019 অ্যাসেসগুলিতে ইতিবাচক ছিল।এটি পরামর্শ দেয় যে বিভিন্ন ধরণের অ্যাসেস জুড়ে ফলাফলের পরিবর্তনশীলতা থাকতে পারে। তবুও, China15-এ পরিচালিত গবেষণায়, দান জিন অ্যাসের ফলাফল তাদের ল্যাব-সংজ্ঞায়িত রেফারেন্স অ্যাসের তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন ছিল (p <0.05)। তবুও, China15-এ পরিচালিত গবেষণায়, দান জিন অ্যাসের ফলাফল তাদের ল্যাব-সংজ্ঞায়িত রেফারেন্স অ্যাসের তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন ছিল (p <0.05)। Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) от. যাইহোক, China15 এর একটি গবেষণায়, ড্যান জিনের বিশ্লেষণের ফলাফল তাদের পরীক্ষাগার রেফারেন্স বিশ্লেষণ থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন ছিল (p <0.05)।然而,在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测牘的参考室定义的参室然而,在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测牘的参考室定义的参考检测縭15 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p < 0,05) যাইহোক, China15-এ একটি গবেষণায়, Daan এর জেনেটিক পরীক্ষার ফলাফল তার রেফারেন্স ল্যাবরেটরি পরীক্ষার তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন ছিল (p <0.05)।SARS-CoV-2 শনাক্ত করার জন্য রেফারেন্স পরীক্ষার সংবেদনশীলতার কারণে এই অসঙ্গতি হতে পারে এবং কারণ নির্ধারণের জন্য আরও অধ্যয়ন গুরুত্বপূর্ণ হতে পারে।
এছাড়াও, আমাদের গবেষণায় CRS-এর সাথে SARS-CoV-2 BGI অ্যাসের তুলনামূলক কর্মক্ষমতা মূল্যায়ন করা হয়েছে, চমৎকার ইতিবাচক শতাংশ চুক্তি (PPA = 97.9%), ঋণাত্মক শতাংশ চুক্তি (NPA = 100%), এবং লিঙ্গ অনুসারে সামগ্রিক শতাংশ চুক্তি ( ওপিএ)।)= 98.8%)।কোহেনের কাপা মানগুলি ভাল চুক্তি দেখিয়েছে (কে = 0.975)।নেদারল্যান্ডস16 এবং চীন15-এর গবেষণায় ধারাবাহিক ফলাফল দেখানো হয়েছে।SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা হল একটি একক জিন (ORF1a/b) সনাক্তকরণ পরীক্ষা যা 10 μl পরিবর্ধন/ডিটেকশন ইলুয়েট ব্যবহার করে।আমাদের রেফারেন্স ফলাফলের সাথে ভাল পরিসংখ্যানগত চুক্তি থাকা সত্ত্বেও, বিশ্লেষণটি মোট নমুনার দুটি ইতিবাচক নমুনা (1.22%) মিস করেছে।রোগী এবং সম্প্রদায় উভয় স্তরেই সংক্রমণ গতিশীলতার জন্য এর বিশাল ক্লিনিকাল প্রভাব থাকতে পারে।
এই গবেষণায় অন্তর্ভুক্ত আরেকটি তুলনামূলক বিশ্লেষণ ছিল Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) অ্যাস;সামগ্রিক ম্যাচ শতাংশ ছিল 96.3%।চুক্তির শক্তিও কোহেনের কাপ্পা মান দ্বারা নির্ধারিত হয়েছিল, যা ছিল 0.925, যা CRS-এর সাথে সম্পূর্ণ চুক্তি নির্দেশ করে।আবার, আমাদের ফলাফলগুলি চীনের চাংশার সেন্ট্রাল সাউথ ইউনিভার্সিটি এবং লিউঝো পিপলস হসপিটালের ক্লিনিক্যাল ল্যাবরেটরি বিভাগে পরিচালিত অধ্যয়নের অনুরূপ, লিউঝো সিটি, চীন17। যদিও উপরের ভাল পরিসংখ্যানগত সমঝোতা রেকর্ড করা হয়েছিল, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) দেখায় যে সানসুর বায়োটেক অ্যাসের ফলাফলে CRS (p <0.005) এর তুলনায় পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য রয়েছে। যদিও উপরের ভাল পরিসংখ্যানগত সমঝোতা রেকর্ড করা হয়েছিল, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) দেখায় যে সানসুর বায়োটেক অ্যাসের ফলাফলে CRS (p <0.005) এর তুলনায় পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য রয়েছে। Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал, что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p < 0,005). যদিও উপরে ভাল পরিসংখ্যানগত চুক্তি রেকর্ড করা হয়েছিল, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) দেখায় যে সানসুর বায়োটেক অ্যাসের ফলাফলে CRS (p <0.005) এর তুলনায় একটি পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য ছিল।尽管 记录 了 上述 良好 的 统计 一致性 一致性 , 但 检验 检验 (ম্যাকনেমার 检验) 表明 , sansure বায়োটেক 检测 的 结果 与 Crs 相比 具有 统计学 显着 差异 (পি <0.005))。。。。 统计学 统计学 显着 差异 (পি <0.005)。。。。。。。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致 性 性 , 但 (((ম্যাকনেমার 检验 表明 , , স্যানসুর বায়োটেক 检测 结果 与 সিআরএস 相比 具有 显着 (পি <0.005 。。。。。。。。。。。。。。。。 。。。。。。。。。。。。。。。。 显着 (পি <0.005 。。。。。。。。。。。。。。。。 。。。。。。。。。。。。。。。。 。。。。。。。。。。。。。。。。 (পি <0.005 。。。。。。。。。。。。。。。。 。。。。。。。。。。。。。。。。 ...))) Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал статистически значимую разницу (p < 0,005) между анализом Sansure Biotech и CRS. উপরে উল্লিখিত ভাল পরিসংখ্যানগত চুক্তি সত্ত্বেও, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) সানসুর বায়োটেক অ্যাস এবং CRS-এর মধ্যে একটি পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য (p <0.005) দেখিয়েছে।সিআরএস (পরিপূরক সারণী 1) এর তুলনায় ছয়টি নমুনা (3.66%) মিথ্যা নেতিবাচক হিসাবে পাওয়া গেছে;এটি খুবই গুরুত্বপূর্ণ, বিশেষ করে ভাইরাসের সংক্রমণের গতিশীলতার কারণে।উপরোক্ত তথ্য এই কম সনাক্তকরণ হার সমর্থন করে15.
এই গবেষণায়, অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাসে রিপোর্ট করা সর্বনিম্ন গড় Ct মান সহ প্রতিটি অ্যাসে এবং সংশ্লিষ্ট প্ল্যাটফর্মের জন্য Ct মান নির্ধারণ করা হয়েছিল।এই ফলাফলটি SARS-CoV-2 সনাক্তকরণের জন্য অ্যাবটের যুগপত সম্মিলিত জেনেটিক টেস্টিং সিস্টেমের সাথে সম্পর্কিত হতে পারে।অতএব, চিত্র 1 অনুসারে, অ্যাবট SARS-CoV-2 ফলাফলের 87.6% এর Ct মান 20 এর নিচে ছিল। শুধুমাত্র অল্প সংখ্যক নমুনা ফলাফল (12.4%) 20-30 রেঞ্জের মধ্যে ছিল।30 এর উপরে Ct মান রেকর্ড করা হয়নি।অ্যাবটের SARS-CoV-2 প্যানেল জেনেটিক টেস্টিং ফরম্যাটের ব্যবহার ছাড়াও, এই ফলাফলটি নিম্ন সনাক্তকরণ সীমা (32.5 RNA কপি/mL)18 এর সাথে সম্পর্কিত হতে পারে, যা কোম্পানির 100 RNA কপির নিম্ন সীমার চেয়ে তিনগুণ কম। /mLমিলি) 19।
এই গবেষণার কিছু সীমাবদ্ধতা রয়েছে: প্রথমত, সম্পদের অভাবের কারণে আমাদের কাছে স্ট্যান্ডার্ড/রেফারেন্স পদ্ধতি [যেমন ভাইরাল লোড বা অন্যান্য পরীক্ষাগার পরীক্ষা (এলডিএ)] নেই।দ্বিতীয়ত, এই গবেষণায় ব্যবহৃত সমস্ত নমুনাগুলি ছিল নাসোফ্যারিঞ্জিয়াল সোয়াব, যখন ফলাফলগুলি অন্যান্য নমুনার প্রকারের ক্ষেত্রে প্রযোজ্য ছিল না এবং তৃতীয়ত, আমাদের নমুনার আকার ছোট ছিল।
এই সমীক্ষায় SARS-CoV-2-এর জন্য চারটি rRT-PCR অ্যাসের পারফরম্যান্সের তুলনা করা হয়েছে নাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা ব্যবহার করে।সানসুর বায়োটেক অ্যাস বাদে সমস্ত সনাক্তকরণ অ্যাসে প্রায় তুলনামূলক কর্মক্ষমতা ছিল। এছাড়াও, CRS (p <0.05) এর তুলনায় সানসুর বায়োটেক অ্যাসেতে কম ইতিবাচক হার চিহ্নিত করা হয়েছিল। এছাড়াও, CRS (p <0.05) এর তুলনায় সানসুর বায়োটেক অ্যাসেতে কম ইতিবাচক হার চিহ্নিত করা হয়েছিল। Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05)। উপরন্তু, Sansure বায়োটেক পরীক্ষা CRS (p <0.05) এর তুলনায় ইতিবাচক ফলাফলের কম শতাংশ দেখিয়েছে।此外,与CRS 相比,সানসুর বায়োটেক 检测的阳性率较低(p <0.05)।此外,与CRS 相比,সানসুর বায়োটেক 检测的阳性率较低(p <0.05)। Кроме того, анализ sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05)। এছাড়াও, CRS (p <0.05) এর তুলনায় সানসুর বায়োটেক অ্যাস-এর ইতিবাচকতার হার কম ছিল।সানসুর বায়োটেক nCoV-2019 (RUO) PPA, NPA এবং সামগ্রিক চুক্তির বিশ্লেষণ 93.5% ছাড়িয়েছে যার চুক্তির মান 0.925 এর কোহেন কাপা শক্তি।অবশেষে, ইথিওপিয়াতে ব্যবহারের জন্য Sansure Biotech Assay (RUO) এর আরও বৈধতা প্রয়োজন, এবং পৃথক নির্মাতাদের দাবিগুলি মূল্যায়ন করার জন্য অতিরিক্ত গবেষণা বিবেচনা করা উচিত।
তুলনামূলক অধ্যয়নের নকশাটি আদ্দিস আবাবা, একা কোটেবে হাসপাতাল, মিলেনিয়াম চার্চ ট্রিটমেন্ট সেন্টার, জেউডিতু মেমোরিয়াল হাসপাতাল এবং সেন্ট পিটারস যক্ষ্মা বিশেষজ্ঞ হাসপাতালে চারটি স্বাস্থ্য সুবিধায় পরিচালিত হয়েছিল।তথ্যটি 1 থেকে 31 ডিসেম্বর, 2020-এর মধ্যে সংগ্রহ করা হয়েছিল৷ এই গবেষণার জন্য চিকিত্সা সুবিধাগুলি উদ্দেশ্যমূলকভাবে তাদের কেসের সংখ্যা এবং শহরের প্রধান চিকিত্সা কেন্দ্রগুলির উপলব্ধতার ভিত্তিতে বেছে নেওয়া হয়েছিল৷একইভাবে, ABI 7500 এবং Abbott m2000 রিয়েল-টাইম পিসিআর যন্ত্রগুলি সহ, NAAT রিএজেন্ট নির্মাতাদের সুপারিশ অনুসারে নির্বাচন করা হয়েছিল, এবং এই গবেষণার জন্য চারটি পিসিআর সনাক্তকরণ কিট নির্বাচন করা হয়েছিল, কারণ ইথিওপিয়ার বেশিরভাগ পরীক্ষাগার কমপক্ষে কমপক্ষে তাদের চার.জিন পরীক্ষা, অ্যাবট SARS-CoV-2 পরীক্ষা, Sansure Biotech পরীক্ষা এবং SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা অধ্যয়নের সময় সম্পাদিত হয়েছে)।
EPHI-তে উল্লেখ করা COVID-19-এর জন্য তদন্তাধীন ব্যক্তিদের কাছ থেকে SARS-CoV-2-এর পরীক্ষা করা হয়েছিল 1 থেকে 30 ডিসেম্বর 2020 পর্যন্ত ভাইরাল ট্রান্সপোর্ট মিডিয়াম (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, China) এর 3 মিলি ব্যবহার করে।প্রশিক্ষিত নমুনা সংগ্রহকারীদের দ্বারা নাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা সংগ্রহ করা হয়েছিল এবং ট্রিপল প্যাকে EPHI-তে পাঠানো হয়েছিল।নিউক্লিক অ্যাসিড বিচ্ছিন্নকরণের আগে, প্রতিটি নমুনাকে একটি অনন্য শনাক্তকরণ নম্বর বরাদ্দ করা হয়।ম্যানুয়াল এবং স্বয়ংক্রিয় নিষ্কাশন পদ্ধতি ব্যবহার করে আগমনের সাথে সাথে প্রতিটি নমুনা থেকে নিষ্কাশন করা হয়।এইভাবে, অ্যাবট m2000-এর স্বয়ংক্রিয় নিষ্কাশনের জন্য, নমুনার 1.3 মিলি (0.8 মিলি ডেড ভলিউম এবং 0.5 মিলি এক্সট্রাকশন ইনলেট ভলিউম সহ) প্রতিটি নমুনা থেকে বের করা হয়েছিল এবং অ্যাবট ডিএনএ স্যাম্পল প্রিপারেশন সিস্টেমের মাধ্যমে পাস করা হয়েছিল (অ্যাবট মলিকুলার ইনক. ডেস প্লেইনস, IL, USA)।) বাস্তব সময়ে SARS-CoV-2 (EUA) এর দুটি রাউন্ডের সামগ্রিক প্রক্রিয়ায় (পুনরুদ্ধার এবং সনাক্তকরণ) 96টি [92 নমুনা, দুটি সনাক্তকরণ নিয়ন্ত্রণ এবং দুটি নন-টেমপ্লেট নিয়ন্ত্রণ (NTC)] অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল।খনিরএকইভাবে, ম্যানুয়াল নিষ্কাশনের জন্য, একই নমুনা ব্যবহার করুন (স্বয়ংক্রিয় নিষ্কাশন এবং আবিষ্কারের জন্য)।এইভাবে, পুরো প্রক্রিয়া জুড়ে, 140 μl নমুনাগুলি নয় রাউন্ডে 24 ব্যাচে (20টি নমুনা, দুটি অ্যাসে কন্ট্রোল এবং দুটি NTC সহ) QIAamp ভাইরাল RNA মিনি কিট (QIAGEN GmbH, Hilden, Germany) ব্যবহার করে আলাদা করা হয়েছে এবং বের করা হয়েছে।SARS-CoV-2 BGI অ্যাস, দান জিন অ্যাস এবং সানসুর বায়োটেক অ্যাস ব্যবহার করে ABI 7500 থার্মাল সাইক্লার ব্যবহার করে ম্যানুয়ালি বের করা ইলুয়েটগুলিকে প্রশস্ত করা হয়েছিল এবং সনাক্ত করা হয়েছিল।
SARS-CoV-2 ভাইরাল আরএনএর স্বয়ংক্রিয় বিচ্ছিন্নতা এবং পরিশোধন অ্যাবট ডিএনএ নমুনা প্রস্তুতির বিকারক ব্যবহার করে চৌম্বকীয় গুটিকা নীতি অনুসরণ করে।নমুনা নিষ্ক্রিয়করণ এবং ভাইরাল কণার দ্রবণীয়করণ প্রোটিনকে বিকৃত করতে এবং RNase নিষ্ক্রিয় করার জন্য গুয়ানিডিন আইসোথিওসায়ানেটযুক্ত একটি ডিটারজেন্ট ব্যবহার করে বাহিত হয়।RNA তারপর সিলিকা ব্যবহার করে কঠিন পর্যায় বিভাজনের মাধ্যমে প্রোটিন থেকে আলাদা করা হয়, অর্থাৎ গুয়ানিডিনিয়াম লবণ এবং লাইসিস বাফারের ক্ষারীয় pH সিলিকার (SiO2) সাথে নিউক্লিক অ্যাসিডের আবদ্ধতাকে উৎসাহিত করে।ধুয়ে ফেলার ধাপটি একটি পরিষ্কার সমাধান তৈরি করতে অবশিষ্ট প্রোটিন এবং ধ্বংসাবশেষ অপসারণ করে।যন্ত্রের চৌম্বক ক্ষেত্র 20,21 ব্যবহার করে সিলিকা-ভিত্তিক মাইক্রোকণা থেকে স্বচ্ছ RNA বিচ্ছিন্ন করা হয়।অন্যদিকে, ম্যানুয়াল আইসোলেশন এবং আরএনএ শুদ্ধিকরণ একটি চৌম্বকীয় স্ট্যান্ডের পরিবর্তে সেন্ট্রিফিউগেশন ব্যবহার করে স্পিন কলাম পদ্ধতির মাধ্যমে সম্পাদিত হয় এবং ইলুয়েন্ট থেকে মাইক্রো পার্টিকেল আলাদা করা হয়।
অ্যাবট রিয়েল-টাইম SARS-CoV-2 সনাক্তকরণ পরীক্ষা (Abbott Molecular, Inc.) প্রস্তুতকারকের নির্দেশ অনুসারে সম্পাদিত হয়েছিল, যা WHO এবং FDA থেকে EUA19,22 পেয়েছে।এই প্রোটোকলে, নিষ্কাশনের আগে নমুনা নিষ্ক্রিয়করণটি 30 মিনিটের জন্য 56 ডিগ্রি সেলসিয়াসে জলের স্নানে সঞ্চালিত হয়েছিল।ভাইরাস নিষ্ক্রিয় হওয়ার পরে, অ্যাবট এম2000 ডিএনএ নমুনা প্রস্তুতি পদ্ধতি ব্যবহার করে 0.5 মিলি ভিটিএম থেকে অ্যাবট এম2000 এসপি যন্ত্রে নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন করা হয়েছিল।প্রস্তুতকারকের মতে।অ্যাবট m2000 RT-PCR যন্ত্র ব্যবহার করে পরিবর্ধন এবং সনাক্তকরণ সম্পাদিত হয়েছিল এবং RdRp এবং N জিনের জন্য দ্বৈত সনাক্তকরণ সম্পাদিত হয়েছিল।ROX) এবং ভিআইসি পি (মালিকানা রঞ্জক) অভ্যন্তরীণ নিয়ন্ত্রণের লক্ষ্যমাত্রা এবং সনাক্তকরণের জন্য, উভয় পরিবর্ধন পণ্যগুলির একযোগে সনাক্তকরণের অনুমতি দেয় 19।
এই কিটের পরিবর্ধন সনাক্তকরণ পদ্ধতি এক-ধাপে RT-PCR প্রযুক্তির উপর ভিত্তি করে।ORF1a/b এবং N জিনগুলিকে দান জিন টেকনোলজি দ্বারা সংরক্ষিত অঞ্চল হিসাবে বেছে নেওয়া হয়েছিল লক্ষ্য অঞ্চলের পরিবর্ধন সনাক্ত করার জন্য।নমুনাগুলিতে SARS-CoV-2 RNA সনাক্ত করার জন্য নির্দিষ্ট প্রাইমার এবং ফ্লুরোসেন্ট প্রোব (FAM লেবেলযুক্ত N জিন প্রোব, ORF1a/b প্রোব VIC লেবেল) ডিজাইন করা হয়েছে।চূড়ান্ত ইলুয়েন্ট এবং মাস্টার মিক্সগুলি 25 μl এর চূড়ান্ত ভলিউমে মাস্টার মিক্সের 20 μl এর সাথে 5 μl eluent যোগ করে প্রস্তুত করা হয়েছিল।এবিআই 750024 রিয়েল-টাইম পিসিআর যন্ত্রে প্রশস্তকরণ এবং সনাক্তকরণ একযোগে সঞ্চালিত হয়েছিল।
ORF1a/b এবং N জিনগুলি Sansure Biotech nCoV-2019 নিউক্লিক অ্যাসিড ডায়াগনস্টিক কিট (ফ্লুরোসেন্ট পিসিআর সনাক্তকরণ) ব্যবহার করে সনাক্ত করা হয়েছিল।ORF1a/b অঞ্চলের জন্য FAM চ্যানেল এবং N জিনের জন্য ROX চ্যানেল নির্বাচন করে প্রতিটি টার্গেট জিনের জন্য নির্দিষ্ট প্রোব প্রস্তুত করুন।এই অ্যাসে কিটটিতে, ইলুয়েন্ট এবং মাস্টার মিক্স রিএজেন্টগুলি নিম্নরূপ যোগ করা হয়েছে: সনাক্তকরণ/পরিবর্ধনের জন্য 30 μl মাস্টার মিক্স রিএজেন্ট এবং 20 μl এল্যুটেড নমুনা প্রস্তুত করুন।রিয়েল-টাইম PCR ABI 750025 পরিবর্ধন/সনাক্তকরণের জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল।
SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা হল COVID-19 নির্ণয়ের জন্য একটি ফ্লুরোসেন্ট রিয়েল-টাইম rRT-PCR কিট।লক্ষ্য অঞ্চলটি SARS-CoV-2 জিনোমের ORF1a/b অঞ্চলে অবস্থিত, যা একটি একক জিন সনাক্তকরণ পদ্ধতি।উপরন্তু, মানুষের গৃহস্থালি জিন β-actin হল একটি অভ্যন্তরীণভাবে নিয়ন্ত্রিত লক্ষ্য জিন।একটি ভাল প্লেটে 20 µl মাস্টার মিক্স রিএজেন্ট এবং 10 µl নিষ্কাশিত RNA নমুনা মিশিয়ে মাস্টার মিক্স প্রস্তুত করা হয়।একটি ABI 7500 ফ্লুরোসেন্ট পরিমাণগত রিয়েল-টাইম পিসিআর যন্ত্রটি পরিবর্ধন এবং সনাক্তকরণের জন্য ব্যবহৃত হয়েছিল।সমস্ত নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন, প্রতিটি অ্যাসের জন্য পিসিআর চালানোর শর্তাবলী এবং ফলাফলের ব্যাখ্যা সংশ্লিষ্ট প্রস্তুতকারকের নির্দেশাবলী অনুসারে সম্পাদিত হয়েছিল (সারণী 3)।
এই তুলনামূলক বিশ্লেষণে, আমরা চারটি বিশ্লেষণের জন্য শতাংশ চুক্তি (ইতিবাচক, নেতিবাচক এবং সামগ্রিক) এবং অন্যান্য তুলনা পরামিতি নির্ধারণ করতে রেফারেন্স স্ট্যান্ডার্ড পদ্ধতি ব্যবহার করিনি।প্রতিটি পরীক্ষার তুলনা সিআরএসের সাথে করা হয়েছিল, এই গবেষণায় সিআরএস নিয়ম "যেকোন ইতিবাচক" দ্বারা সেট করা হয়েছিল এবং ফলাফল নির্ধারণ করা হয়েছিল, একটি একক পরীক্ষা দ্বারা নয়, আমরা কমপক্ষে দুটি মিলে যাওয়া পরীক্ষার ফলাফল ব্যবহার করেছি।এছাড়াও, COVID-19 সংক্রমণের ক্ষেত্রে, মিথ্যা নেতিবাচক ফলাফলগুলি মিথ্যা ইতিবাচক ফলাফলের চেয়ে বেশি বিপজ্জনক।অতএব, একটি CRS ফলাফল থেকে যথাসম্ভব নির্ভুলভাবে "ইতিবাচক" বলার জন্য, কমপক্ষে দুটি অ্যাসে পরীক্ষা অবশ্যই ইতিবাচক হতে হবে, যার অর্থ একটি EUA অ্যাস থেকে অন্তত একটি ইতিবাচক ফলাফল আসার সম্ভাবনা রয়েছে।এইভাবে, চারটি পরীক্ষার ফলাফলের মধ্যে, দুই বা ততোধিক পরীক্ষার ফলাফল যা একই ফলাফল দেয় তা সত্য ইতিবাচক বা নেতিবাচক 18,27 হিসাবে বিবেচিত হয়।
স্ট্রাকচার্ড ডেটা এক্সট্র্যাকশন ফর্ম ব্যবহার করে ডেটা সংগ্রহ করা হয়েছিল, এক্সেল স্ট্যাটিসটিকাল সফ্টওয়্যার এবং বর্ণনামূলক পরিসংখ্যানের জন্য SPSS সংস্করণ 23.0 ব্যবহার করে ডেটা এন্ট্রি এবং বিশ্লেষণ করা হয়েছিল।ইতিবাচক, নেতিবাচক এবং সামগ্রিক শতাংশ চুক্তি বিশ্লেষণ করা হয়েছিল, এবং CRS-এর সাথে প্রতিটি পদ্ধতির চুক্তির ডিগ্রি নির্ধারণ করতে একটি কাপ্পা স্কোর ব্যবহার করা হয়েছিল।কাপা মানগুলি নিম্নরূপ ব্যাখ্যা করা হয়: হালকা চুক্তির জন্য 0.01 থেকে 0.20, সাধারণ চুক্তির জন্য 0.21 থেকে 0.40, মধ্যপন্থী চুক্তির জন্য 0.41-0.60, প্রধান চুক্তির জন্য 0.61-0.80 এবং সম্পূর্ণ চুক্তির জন্য 0.81-0.99৷
আদ্দিস আবাবা বিশ্ববিদ্যালয় থেকে নৈতিক ছাড়পত্র প্রাপ্ত হয়েছিল এবং এই গবেষণার জন্য সমস্ত পরীক্ষামূলক প্রোটোকল ইথিওপিয়ান পাবলিক হেলথ ইনস্টিটিউটের বৈজ্ঞানিক নীতি পর্যালোচনা বোর্ড দ্বারা অনুমোদিত হয়েছিল।EPHI এথিক্স লাইসেন্সের রেফারেন্স নম্বর হল EPHI/IRB-279-2020।কোভিড-১৯ এর চিকিৎসার জন্য ইথিওপিয়ান জাতীয় ব্যাপক নির্দেশিকাগুলির সুপারিশ এবং বিধান অনুসারে সমস্ত পদ্ধতি প্রয়োগ করা হয়েছিল।এছাড়াও, অধ্যয়নে অংশগ্রহণের আগে সমস্ত অধ্যয়ন অংশগ্রহণকারীদের কাছ থেকে লিখিত অবহিত সম্মতি প্রাপ্ত হয়েছিল।
এই গবেষণায় প্রাপ্ত বা বিশ্লেষণ করা সমস্ত তথ্য এই প্রকাশিত নিবন্ধে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে।এই গবেষণার ফলাফল সমর্থনকারী ডেটা যুক্তিসঙ্গত অনুরোধের ভিত্তিতে সংশ্লিষ্ট লেখকের কাছ থেকে পাওয়া যায়।
বিশ্ব স্বাস্থ্য সংস্থা.COVID-19-এর জন্য ল্যাবরেটরি টেস্টিং কৌশলগুলির জন্য সুপারিশ: অন্তর্বর্তী নির্দেশিকা, 21 মার্চ, 2020 নম্বর WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020)।
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 স্মার্ট ডায়াগনোসিস ইন দ্য ইমার্জেন্সি ডিপার্টমেন্ট: অল-ইন প্র্যাকটিস। Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 স্মার্ট ডায়াগনোসিস ইন দ্য ইমার্জেন্সি ডিপার্টমেন্ট: অল-ইন প্র্যাকটিস।Muliou, DS, Pantazopoulos, I. এবং Gurgulianis, KI বুদ্ধিমান জরুরী বিভাগে COVID-19 এর নির্ণয়: অনুশীলনে সবকিছু।Muliou DS, Pantazopoulos I. এবং Gurgulyanis KI জরুরী বিভাগে COVID-19 এর বুদ্ধিমান নির্ণয়: অনুশীলনে শেষ থেকে শেষ একীকরণ।বিশেষজ্ঞ রেভারেন্ড রেসপায়ার।ঔষধ.3, 263–272 (2022)।
মিচেল, এসএল এবং সেন্ট জর্জ, কে. কোভিড-১৯ আইডি NOW EUA অ্যাস এর মূল্যায়ন। মিচেল, এসএল এবং সেন্ট জর্জ, কে. কোভিড-১৯ আইডি NOW EUA অ্যাস এর মূল্যায়ন।মিচেল, এসএল এবং সেন্ট জর্জ, কে. কোভিড-১৯ আইডি এখন ইইউএ অ্যাস এর মূল্যায়ন।মিশেল এসএল এবং সেন্ট জর্জ কে. COVID19 আইডি NOW EUA অ্যাস এর মূল্যায়ন।জে. ক্লিনিক্যাল।ভাইরাস.128, 104429। https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020)।
WHO.সন্দেহভাজন মানব রোগে করোনাভাইরাস রোগ 2019 (COVID-19) এর ল্যাবরেটরি সনাক্তকরণ।https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (অ্যাক্সেস 15 আগস্ট 2020) (WHO, 2020)।
উদুগামা, বি. এট আল।COVID-19 রোগ নির্ণয়: রোগ এবং পরীক্ষার সরঞ্জাম।ACS Nano 14(4), 3822–3835 (2020)।
সৈয়দ এস. এট আল.পূর্ব, মধ্য এবং দক্ষিণ আফ্রিকার প্যাথলজিস্ট কলেজের প্রতিষ্ঠা - মধ্য প্রাচ্য এবং দক্ষিণ আফ্রিকার প্যাথলজির আঞ্চলিক স্কুল।আফ্রিকা।জে ল্যাব।ঔষধ.9(1), 1-8 (2020)।
ইথিওপিয়ান ইনস্টিটিউট অফ পাবলিক হেলথ, ফেডারেল স্বাস্থ্য মন্ত্রণালয়।কোভিড-১৯ এর ল্যাবরেটরি রোগ নির্ণয়ের জন্য অন্তর্বর্তীকালীন জাতীয় কৌশল এবং নির্দেশিকা।https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (12 আগস্ট 2020 এ অ্যাক্সেস করা হয়েছে) (EPHI, 2020)।
ওলোশিন, এস., প্যাটেল, এন. এবং কেসেলহেইম, AS SARS-CoV-2 সংক্রমণের চ্যালেঞ্জ এবং প্রভাবগুলির জন্য মিথ্যা নেতিবাচক পরীক্ষা। ওলোশিন, এস., প্যাটেল, এন. এবং কেসেলহেইম, AS SARS-CoV-2 সংক্রমণের চ্যালেঞ্জ এবং প্রভাবগুলির জন্য মিথ্যা নেতিবাচক পরীক্ষা।ভোলোশিন এস., প্যাটেল এন. এবং কেসেলহেইম এএস SARS-CoV-2 সংক্রমণ এবং তাদের পরিণতির জন্য মিথ্যা-নেতিবাচক পরীক্ষা।ভলোশিন এস., প্যাটেল এন. এবং কেসেলহেইম এএস প্ররোচনা এবং SARS-CoV-2 সংক্রমণের প্রভাবের জন্য মিথ্যা-নেতিবাচক পরীক্ষা।এন. ইঞ্জি.জে মেডিসিন।383(6), e38 (2020)।
মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগৌলিয়ানিস, কেআই মিথ্যা-পজিটিভ এবং মিথ্যা-নেতিবাচক COVID-19 কেস: শ্বাসযন্ত্রের প্রতিরোধ এবং পরিচালনার কৌশল, টিকাকরণ এবং আরও দৃষ্টিকোণ। মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগৌলিয়ানিস, কেআই মিথ্যা-পজিটিভ এবং মিথ্যা-নেতিবাচক COVID-19 কেস: শ্বাসযন্ত্রের প্রতিরোধ এবং পরিচালনার কৌশল, টিকাকরণ এবং আরও দৃষ্টিকোণ। মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগৌলিয়ানিস, কেআই লোজনোপোলোজিট্যালনি এবং লোজনোটরিস্যাটেলনিয়ে স্লুচ্যাই কোভিড-19: রেসপিরাটোরনায়া প্রফিলাক্টিকা এবং স্ট্র্যাটেজি, স্ট্র্যাটেজি, মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগৌলিয়ানিস, কেআই কোভিড-১৯ এর মিথ্যা ইতিবাচক এবং মিথ্যা নেতিবাচক কেস: শ্বাসযন্ত্রের প্রতিরোধ এবং চিকিত্সার কৌশল, টিকা এবং এগিয়ে যাওয়ার পথ।মুলিউ, ডিএস এবং গুরগুলিয়ানিস, কেআইআই মিথ্যা-পজিটিভ এবং মিথ্যা-নেতিবাচক ক্ষেত্রে COVID-19: শ্বাসযন্ত্রের প্রতিরোধ এবং চিকিত্সা, টিকা এবং এগিয়ে যাওয়ার কৌশল।বিশেষজ্ঞ রেভারেন্ড রেসপায়ার।ঔষধ.15(8), 993–1002 (2021)।
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. জরুরী বিভাগে কোভিড-19 রোগ নির্ণয়: গাছ দেখা কিন্তু বন হারাচ্ছে। Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. জরুরী বিভাগে কোভিড-19 রোগ নির্ণয়: গাছ দেখা কিন্তু বন হারাচ্ছে।মৌলিউ, ডিএস, আয়ানিস, পি. এবং কনস্টান্টিনোস, জি. জরুরী বিভাগে কোভিড-১৯ রোগ নির্ণয়: বৃক্ষ দেখুন, বন হারান।Muliou DS, Ioannis P., এবং Konstantinos G. জরুরী কক্ষে COVID-19 রোগ নির্ণয়: গাছের জন্য যথেষ্ট বন নয়।হাজির।ঔষধ.J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022)।
Degli-Angeli, E. et al.অ্যাবট রিয়েলটাইম SARS-CoV-2 অ্যাসের বিশ্লেষণাত্মক এবং ক্লিনিকাল পারফরম্যান্সের বৈধতা এবং বৈধতা।জে. ক্লিনিক্যাল।ভাইরাস.129, 104474। https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020)।
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. প্রচলিত RT-PCR দ্বারা ভাইরাস সংক্রমণ শনাক্ত করার জন্য COVID-19-এর বিভিন্ন জিনোম অঞ্চল থেকে পাঁচটি প্রাইমার সেটের তুলনা। Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. প্রচলিত RT-PCR দ্বারা ভাইরাস সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য COVID-19 এর বিভিন্ন জিনোম অঞ্চল থেকে পাঁচটি প্রাইমার সেটের তুলনা।Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. এবং Aflatunyan, B. প্রচলিত RT-PCR দ্বারা ভাইরাল সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য COVID-19 জিনোমের বিভিন্ন অঞ্চল থেকে প্রাইমারের পাঁচ সেটের তুলনা। মোল্লাই, এইচআর, আফশার, এএ, কালান্তর-নেয়েস্তানাকি, ডি., ফজলালিপুর, এম. এবং আফলাতুনিয়ান, বি. 比较来自COVID-19 不同基因组区域的五个式,意愛田基基因组区域的五个引,愛田基基因组区域的五个引。 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. প্রচলিত RT-PCR দ্বারা ভাইরাল সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য COVID-19-এর 5টি ভিন্ন জেনেটিক অঞ্চলের তুলনা।মোল্লাই এইচআর, আফশার এএ, কালান্তার-নেয়েস্তানাকি ডি, ফজলালিপুর এম. এবং আফলাতুনিয়ান বি। প্রচলিত RT-PCR দ্বারা ভাইরাল সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য COVID-19 জিনোমের বিভিন্ন অঞ্চল থেকে প্রাইমারের পাঁচ সেটের তুলনা।ইরান।J. মাইক্রোবায়োলজি।12(3), 185 (2020)।
Goertzer, I. et al.SARS-CoV-2 জিনোম সিকোয়েন্স সনাক্তকরণের জন্য জাতীয় বাহ্যিক গুণমান মূল্যায়ন প্রোগ্রামের প্রাথমিক ফলাফল।জে. ক্লিনিক্যাল।ভাইরাস.129, 104537। https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020)।
ওয়াং, এম. এট আল।সিভিয়ার অ্যাকিউট রেসপিরেটরি সিন্ড্রোম করোনাভাইরাসের জন্য পাঁচটি আরটি-পিসিআর কিটের কার্যকারিতার বিশ্লেষণাত্মক মূল্যায়ন 2. জে. ক্লিনিক্যাল।পরীক্ষাগারমলদ্বার35(1), e23643 (2021)।
ওয়াং বি. এট আল।রিয়েল-টাইম পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (পিসিআর) এর উপর ভিত্তি করে চীনে বাণিজ্যিকভাবে উপলব্ধ সাতটি SARS-CoV-2 RNA সনাক্তকরণ কিটের মূল্যায়ন।ক্লিনিক্যালরাসায়নিক।পরীক্ষাগারঔষধ.58(9), e149–e153 (2020)।
ভ্যান কাস্টেরেন, পিবি এট আল।সাতটি বাণিজ্যিক RT-PCR COVID-19 ডায়াগনস্টিক কিটের তুলনা।জে. ক্লিনিক্যাল।ভাইরাস.128, 104412 (2020)।
লু, ইউ, এট আল।SARS-CoV-2 নিউক্লিক অ্যাসিড সনাক্তকরণের জন্য দুটি পিসিআর কিটের ডায়াগনস্টিক কর্মক্ষমতার তুলনা।জে. ক্লিনিক্যাল।পরীক্ষাগারমলদ্বার34(10), e23554 (2020)।
Lefart, PR, ইত্যাদি। চারটি SARS-CoV-2 নিউক্লিক অ্যাসিড অ্যামপ্লিফিকেশন টেস্টিং (NAAT) প্ল্যাটফর্মের একটি তুলনামূলক গবেষণায় দেখা গেছে যে ID NOW কর্মক্ষমতা রোগী এবং নমুনার প্রকারের উপর নির্ভর করে উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস পেয়েছে।রোগ নির্ণয়মাইক্রোবায়োলজিসংক্রমিত।diss99(1), 115200 (2021)।
অ্যাবট অণু।অ্যাবট রিয়েল-টাইম SARS-CoV-2 বিশ্লেষণ প্যাকেজ সন্নিবেশ।https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay।1-12।(10 আগস্ট, 2020 অনুযায়ী) (2020)।
ক্লেইন, এস. এট আল।RT-qPCR এবং RT-LAMP দ্বারা দ্রুত বড় আকারের সনাক্তকরণের জন্য চৌম্বক পুঁতি ব্যবহার করে SARS-CoV-2 RNA বিচ্ছিন্নতা।ভাইরাস 12(8), 863 (2020)।


পোস্টের সময়: ডিসেম্বর-০৮-২০২২