ইথিওপিয়ায় SARS-CoV-2 শনাক্ত করার জন্য চারটি নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন পরীক্ষায় পারফর্মেন্স

Nature.com দেখার জন্য আপনাকে ধন্যবাদ। আপনি সীমিত CSS সমর্থন সহ একটি ব্রাউজার সংস্করণ ব্যবহার করছেন। সেরা অভিজ্ঞতার জন্য, আমরা আপনাকে একটি আপডেট করা ব্রাউজার ব্যবহার করার পরামর্শ দিচ্ছি (অথবা ইন্টারনেট এক্সপ্লোরারে সামঞ্জস্যতা মোড অক্ষম করুন)। এছাড়াও, চলমান সহায়তা নিশ্চিত করার জন্য, আমরা স্টাইল এবং জাভাস্ক্রিপ্ট ছাড়াই সাইটটি দেখাই।
একসাথে তিনটি স্লাইডের একটি ক্যারোজেল প্রদর্শন করে। একসাথে তিনটি স্লাইডের মধ্য দিয়ে যেতে পূর্ববর্তী এবং পরবর্তী বোতামগুলি ব্যবহার করুন, অথবা শেষে স্লাইডার বোতামগুলি ব্যবহার করে একবারে তিনটি স্লাইডের মধ্য দিয়ে যান।
২০১৯ সালে করোনাভাইরাস রোগ (COVID-19) প্রাদুর্ভাবের পর থেকে, বিশ্বজুড়ে অনেক বাণিজ্যিক নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন পরীক্ষা (NAATs) তৈরি করা হয়েছে এবং স্ট্যান্ডার্ড অ্যাসে পরিণত হয়েছে। যদিও বেশ কয়েকটি পরীক্ষা দ্রুত তৈরি করা হয়েছিল এবং ল্যাবরেটরি ডায়াগনস্টিক পরীক্ষায় প্রয়োগ করা হয়েছিল, তবুও বিভিন্ন সেটিংসে এই পরীক্ষার কার্যকারিতা মূল্যায়ন করা হয়নি। অতএব, এই গবেষণার লক্ষ্য ছিল কম্পোজিট রেফারেন্স স্ট্যান্ডার্ড (CRS) ব্যবহার করে Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI এবং Sansure Biotech অ্যাসেসের কার্যকারিতা মূল্যায়ন করা। এই গবেষণাটি ইথিওপিয়ান পাবলিক হেলথ ইনস্টিটিউটে (EPHI) ১ থেকে ৩০ ডিসেম্বর ২০২০ পর্যন্ত পরিচালিত হয়েছিল। QIAamp RNA মিনি কিট এবং Abbott DNA নমুনা প্রস্তুতি ব্যবস্থা ব্যবহার করে ১৬৪টি ন্যাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা বের করা হয়েছিল। ১৬৪টি নমুনার মধ্যে, ৫৯.১% ইতিবাচক এবং ৪০.৯% CRS-এর জন্য নেতিবাচক ছিল। সিআরএসের তুলনায় স্যানসিওর বায়োটেকের পজিটিভিটি উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল (p < 0.05)। সিআরএসের তুলনায় স্যানসিওর বায়োটেকের পজিটিভিটি উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল (p < 0.05)। Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p < 0,05)। স্যানসিওর বায়োটেকের ইতিবাচক ফলাফল CRS-এর তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল (p < 0.05)।与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）।与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）। У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05)। সিআরএসের তুলনায় স্যানসিওর বায়োটেকের ইতিবাচক ফলাফল উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল (p < 0.05)।CRS-এর তুলনায় চারটি বিশ্লেষণের সামগ্রিক মিল ছিল ৯৬.৩–১০০%। স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাসের কম পজিটিভিটি হার ছাড়াও, চারটি অ্যাসের কর্মক্ষমতা প্রায় তুলনীয় ছিল। ফলে, ইথিওপিয়ায় স্যানসিওর বায়োটেক [রিসার্চ অনলি (RUO)] অ্যাসের ব্যবহারের জন্য অতিরিক্ত বৈধতা প্রয়োজন। পরিশেষে, উপযুক্ত প্রস্তুতকারকের দাবির সাথে অ্যাসের মূল্যায়নের জন্য অতিরিক্ত গবেষণা বিবেচনা করা উচিত।
ল্যাবরেটরি পরীক্ষা বিশ্ব স্বাস্থ্য সংস্থার (WHO) করোনাভাইরাস রোগ ২০১৯ (COVID-19) প্রস্তুতি এবং প্রতিক্রিয়া (SPRP) কৌশলগত পরিকল্পনার অংশ। WHO পরামর্শ দেয় যে দেশগুলিকে প্রস্তুতি, সঠিক কেস ব্যবস্থাপনা, সতর্কতা এবং জনস্বাস্থ্য চ্যালেঞ্জগুলির দ্রুত প্রতিক্রিয়া উন্নত করার জন্য ল্যাবরেটরি সক্ষমতা তৈরি করতে হবে। এটি পরামর্শ দেয় যে উদ্ভূত সংক্রামক এজেন্টগুলির রোগ এবং মহামারীবিদ্যা চিহ্নিতকরণ এবং তাদের বিস্তার নিয়ন্ত্রণে ল্যাবরেটরির ভূমিকা গুরুত্বপূর্ণ।
COVID-19 রোগ নির্ণয়ের জন্য মহামারী সংক্রান্ত এবং চিকিৎসা সংক্রান্ত তথ্য, ব্যক্তিগত লক্ষণ/লক্ষণ এবং রেডিওগ্রাফিক এবং পরীক্ষাগার তথ্য প্রয়োজন। চীনের উহানে COVID-19 প্রাদুর্ভাবের খবর পাওয়ার পর থেকে, বিশ্বজুড়ে অনেক বাণিজ্যিক নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন পরীক্ষা (NAAT) তৈরি করা হয়েছে। রিয়েল-টাইম রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (rRT-PCR) গুরুতর তীব্র শ্বাসযন্ত্রের সিন্ড্রোম 2 (SARS-CoV-2)3 সংক্রমণের পরীক্ষাগার নির্ণয়ের জন্য একটি নিয়মিত এবং মানক পদ্ধতি হিসাবে ব্যবহৃত হয়েছে। SARS-CoV-2 এর আণবিক সনাক্তকরণ সাধারণত ভাইরাল জিনোম থেকে চিহ্নিত ORF1a/b (ওপেন রিডিং ফ্রেম 1a/b) জিন) অঞ্চলে N (নিউক্লিওক্যাপসিড প্রোটিন জিন), E (এনভেলপ প্রোটিন জিন), এবং RdRp (RNA-নির্ভর RNA পলিমারেজ জিন) জিনের উপর ভিত্তি করে করা হয়। ভাইরাস সনাক্তকরণের জন্য এগুলিকে ভাইরাল জিনোমে পাওয়া প্রধান সংরক্ষিত অঞ্চল হিসাবে বিবেচনা করা হয়। এই জিনগুলির মধ্যে, RdRp এবং E জিনের বিশ্লেষণাত্মক সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা উচ্চ, যেখানে N জিনের বিশ্লেষণাত্মক সংবেদনশীলতা কম।
পিসিআর অ্যাসের কার্যকারিতা বিভিন্ন কারণের উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত হতে পারে যেমন: এক্সট্রাকশন রিএজেন্ট, অ্যামপ্লিফিকেশন/ডিটেকশন রিএজেন্ট, এক্সট্রাকশন পদ্ধতি, পিসিআর মেশিনের গুণমান এবং অন্যান্য যন্ত্র। এপ্রিল ২০২০ পর্যন্ত, নয়টি দেশের ৪৮টিরও বেশি বিভিন্ন ডায়াগনস্টিক ডিভাইস COVID-196 ডায়াগনস্টিকসের জন্য জরুরি ব্যবহারের অনুমোদন (EUA) পেয়েছে। ইথিওপিয়ায়, ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 এবং Quant-studio7 সহ ২৬টি জনস্বাস্থ্য প্রতিষ্ঠানে SARS-CoV-2 এর পিসিআর সনাক্তকরণের জন্য ১৪টিরও বেশি রিয়েল-টাইম পিসিআর প্ল্যাটফর্ম ব্যবহার করা হয়। এছাড়াও, বিভিন্ন পিসিআর পরীক্ষার কিট পাওয়া যায়, যেমন Daan Gene test, Abbott SARS-CoV-2 test, Sansure Biotech test, এবং SARS-CoV-2 BGI test। যদিও rRT-PCR অত্যন্ত সংবেদনশীল, COVID-19 আক্রান্ত কিছু রোগী অনুপযুক্ত সংগ্রহ, পরিবহন, সংরক্ষণ এবং পরিচালনা এবং পরীক্ষাগার পরীক্ষার কারণে নমুনায় ভাইরাল রাইবোনিউক্লিক অ্যাসিড (RNA) এর অপর্যাপ্ত কপির কারণে মিথ্যা নেতিবাচক ফলাফল রিপোর্ট করেন। কর্মীদের অবস্থা এবং ক্রিয়াকলাপ। এছাড়াও, নমুনা বা নিয়ন্ত্রণের ভুল ব্যবস্থাপনা, চক্রের থ্রেশহোল্ড (Ct) সেটিং এবং অন্যান্য প্যাথোজেনিক নিউক্লিক অ্যাসিড বা নিষ্ক্রিয়/অবশিষ্ট SARS-CoV-2 RNA-এর সাথে ক্রস-রিঅ্যাক্টিভিটি rRT-PCR9 পরীক্ষায় মিথ্যা ইতিবাচক ফলাফলের দিকে নিয়ে যেতে পারে। সুতরাং, এটা স্পষ্ট যে PCR পরীক্ষাগুলি প্রকৃতপক্ষে জিনের টুকরোগুলির বাহক সনাক্ত করতে পারে, কারণ তারা সত্যিকারের সক্রিয় ভাইরাল জিনের মধ্যে পার্থক্যও করতে পারে না, তাই পরীক্ষাগুলি কেবল বাহক সনাক্ত করতে পারে, রোগীদের নয়। অতএব, আমাদের পরিবেশে স্ট্যান্ডার্ড পদ্ধতি ব্যবহার করে ডায়াগনস্টিক কর্মক্ষমতা মূল্যায়ন করা গুরুত্বপূর্ণ। যদিও ইথিওপিয়ান পাবলিক হেলথ ইনস্টিটিউট (EPHI) এবং সারা দেশে অনেক NAAT রিএজেন্ট পাওয়া যায়, তবুও তাদের কার্যকারিতার কোনও তুলনামূলক মূল্যায়ন এখনও রিপোর্ট করা হয়নি। অতএব, এই গবেষণার লক্ষ্য ক্লিনিকাল নমুনা ব্যবহার করে rRT-PCR দ্বারা SARS-CoV-2 সনাক্তকরণের জন্য বাণিজ্যিকভাবে উপলব্ধ কিটগুলির তুলনামূলক কর্মক্ষমতা মূল্যায়ন করা।
এই গবেষণায় মোট ১৬৪ জন অংশগ্রহণকারীকে সন্দেহভাজন COVID-19 আক্রান্ত হিসেবে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল। বেশিরভাগ নমুনা চিকিৎসা কেন্দ্র থেকে নেওয়া হয়েছিল (১১৮/১৬৪ = ৭২%), বাকি ৪৬ জন (২৮%) অংশগ্রহণকারী ছিলেন চিকিৎসা কেন্দ্র থেকে নয়। কেন্দ্রে চিকিৎসা না করা অংশগ্রহণকারীদের মধ্যে ১৫ জনের (৯.১%) ক্লিনিক্যালি সন্দেহভাজন রোগী ছিল এবং ৩১ জনের (১৮.৯%) নিশ্চিত রোগীর সংস্পর্শে এসেছিলেন। ৯৩ জন (৫৬.৭%) অংশগ্রহণকারী পুরুষ ছিলেন এবং অংশগ্রহণকারীদের গড় (± SD) বয়স ছিল ৩১.১০ (± ১১.৮২) বছর।
এই গবেষণায়, COVID-19 এর জন্য চারটি পরীক্ষার ইতিবাচক এবং নেতিবাচক হার নির্ধারণ করা হয়েছিল। সুতরাং, Abbott SARS-CoV-2 পরীক্ষা, Daan Gene 2019-nCoV পরীক্ষা, SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা এবং Sansure Biotech 2019-nCoV পরীক্ষায় ইতিবাচক হার ছিল যথাক্রমে 59.1%, 58.5%, 57.9% এবং 55.5%। ইতিবাচক এবং নেতিবাচক কম্পোজিট রেফারেন্স স্ট্যান্ডার্ড (CRS) স্কোর ছিল যথাক্রমে 97 (59.1%) এবং 67 (40.9%) (সারণী 1)। এই গবেষণায়, CRS এর সংজ্ঞা "যেকোনো ইতিবাচক" নিয়মের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছিল, যেখানে চারটি পরীক্ষার ফলাফলের মধ্যে, একই ফলাফল দেওয়া দুই বা ততোধিক পরীক্ষার ফলাফলকে সত্য ইতিবাচক বা নেতিবাচক হিসাবে বিবেচনা করা হয়েছিল।
এই গবেষণায়, আমরা CRS-এর তুলনায় সকল বিশ্লেষণের জন্য ১০০% (৯৫% CI ৯৪.৬–১০০) নেতিবাচক শতাংশ চুক্তি (NPA) পেয়েছি। Sansure Biotechnology বিশ্লেষণে সর্বনিম্ন PPA ৯৩.৮% (৯৫% CI ৮৭.২-৯৭.১) দেখানো হয়েছে এবং Daan Gene 2019-nCoV বিশ্লেষণে সামগ্রিকভাবে ৯৯.৪% (৯৫% CI ৯৬.৬-৯৯.৯) চুক্তি ছিল। বিপরীতে, SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা এবং Sansure Biotech 2019-nCoV পরীক্ষায় সামগ্রিকভাবে চুক্তি ছিল যথাক্রমে ৯৮.৮% এবং ৯৬.৩% (সারণী ২)।
CRS এবং Abbott SARS-CoV-2 পরীক্ষার ফলাফলের মধ্যে কোহেনের কাপ্পা সহগের সমঝোতা সম্পূর্ণরূপে সামঞ্জস্যপূর্ণ ছিল (K = 1.00)। একইভাবে, Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, এবং Sansure Biotech 2019-nCoV দ্বারা সনাক্ত করা কোহেনের কাপ্পা মানগুলিও CRS (K ≥ 0.925) এর সাথে সম্পূর্ণরূপে সামঞ্জস্যপূর্ণ। এই তুলনামূলক বিশ্লেষণে, chi-square পরীক্ষা (McNemar পরীক্ষা) দেখিয়েছে যে Sansure Biotech 2019-nCoV পরীক্ষার ফলাফল CRS ফলাফল (p = 0.031) (সারণী 2) থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা ছিল।
চিত্রে দেখানো হয়েছে।১. অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাসের (RdRp এবং N জিনের সম্মিলিত) সর্বনিম্ন Ct মানের (<20 Ct) শতাংশ ছিল ৮৭.৬% এবং স্যানসিওর বায়োটেক ২০১৯-nCoV অ্যাসের ORF1a/b জিনের Ct মান দেখিয়েছে যে নিম্ন Ct মানের (<20 Ct) শতাংশ ছিল ৫০.৩% এবং উচ্চ Ct মানের (36-40 Ct) ছিল ৩.২%। ১. অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাসের (RdRp এবং N জিনের সম্মিলিত) সর্বনিম্ন Ct মানের (<20 Ct) শতাংশ ছিল ৮৭.৬% এবং স্যানসিওর বায়োটেক ২০১৯-nCoV অ্যাসের ORF1a/b জিনের Ct মান দেখিয়েছে যে নিম্ন Ct মানের (<20 Ct) শতাংশ ছিল ৫০.৩% এবং উচ্চ Ct মানের (36-40 Ct) ছিল ৩.২%।চিত্রে দেখানো হয়েছে।1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) অ্যানালিজা অ্যাবট SARS-CoV-2 (কোমবিনিরোভাননый ген RdRp и N) составил 87,6%, Cbt/a সানসুর বায়োটেক 2019-nCoV-এর নাম 3,2%। ১, অ্যাবট SARS-CoV-2 (সংযুক্ত জিন RdRp এবং N) এর সর্বনিম্ন Ct মানের (<20 Ct) বিশ্লেষণের শতাংশ ছিল ৮৭.৬%, এবং স্যানসিওর বায়োটেক ২০১৯-nCoV এর ORF1a/b জিন বিশ্লেষণের Ct মান দেখিয়েছে যে নিম্ন Ct মানের (<20 Ct) শতাংশ ৫০.৩% এবং উচ্চ মানের Ct (36-40 Ct) শতাংশ ৩.২%।如图1 所示，Abbot SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20 Ct.6% বায়োটেক. 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(<20 Ct) 的百分比为50.3%,高Ct 值的人示低%36–40%. চিত্র ১-এ দেখানো হয়েছে, অ্যাবট SARS-CoV-2 পরীক্ষার (RdRp এবং N জিনের সংমিশ্রণ) সর্বনিম্ন Ct মান শতাংশ (<20 Ct) 87.6%, Sansure Biotech 2019-nCoV পরীক্ষার ORF1a/b জিন Ct মান কম Ct值(<20 Ct) শতাংশ দেখায় 50.3%, 高Ct 值(36–40 Ct) শতাংশ 3.2%। Как показано на рисунке 1, অ্যাবট SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) নামে পরিচিত 87,6%, а значение Ct gena ORF1a/b исследовании Sansure Biotech 2019- অ্যানালিজ nCoV показал низкий Ct. চিত্র ১-এ দেখানো হয়েছে, অ্যাবট SARS-CoV-2 অ্যাসে (RdRp এবং N জিনের সমন্বয়ে) সর্বনিম্ন শতাংশ Ct মান (<20 Ct) ছিল 87.6%, যেখানে Sansure Biotech 2019 গবেষণায় ORF1a/b জিনের Ct মান ছিল কম Ct। Процент значений (<20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) составил 3,2%। মানের শতাংশ (<20 Ct) ছিল 50.3%, এবং উচ্চ Ct মানের (36–40 Ct) শতাংশ ছিল 3.2%।অ্যাবট SARS-CoV-2 B পরীক্ষায় Ct মান 30 এর উপরে রেকর্ড করা হয়েছে। অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 পরীক্ষায় ORF1a/b জিনের উচ্চ Ct মান (> 36 Ct) ছিল, শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)। অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 পরীক্ষায় ORF1a/b জিনের উচ্চ Ct মান (> 36 Ct) ছিল, শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)। С другой стороны, BGI SARS-CoV-2 gen ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составля (%41рис). অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 জিনের বিশ্লেষণে ORF1a/b এর উচ্চ Ct মান (> 36 Ct) ছিল, যার শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)।另一方面，BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（>36 Ct）的百分比为4%（弈因 অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 সনাক্তকরণে, উচ্চ Ct মান (>36 Ct) সহ ORF1a/b জিনের শতাংশ 4% (চিত্র 1)। С другой стороны, BGI SARS-CoV-2 PROcent genov ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (ris.1). অন্যদিকে, BGI SARS-CoV-2 বিশ্লেষণে, উচ্চ Ct মান (>36 Ct) সহ ORF1a/b জিনের শতাংশ ছিল 4% (চিত্র 1)।
এই গবেষণায়, আমরা ১৬৪টি ন্যাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা সংগ্রহ করেছি। সকল ধরণের পরীক্ষার জন্য, সংশ্লিষ্ট নির্মাতাদের দ্বারা সুপারিশকৃত পদ্ধতি এবং কিট ব্যবহার করে RNA বিচ্ছিন্নতা এবং পরিবর্ধন করা হয়েছিল।
এই গবেষণায় দেখা গেছে যে SARS-CoV-2 এর জন্য অ্যাবটের পরীক্ষার সনাক্তকরণ কর্মক্ষমতা CRS এর মতোই, যার ১০০% ইতিবাচক, নেতিবাচক এবং সামগ্রিক সঙ্গতি রয়েছে। কোহেনের কাপ্পা চুক্তি ১.০০, যা CRS এর সাথে সম্পূর্ণ সম্মতি নির্দেশ করে। মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের ওয়াশিংটন বিশ্ববিদ্যালয়ের অনুরূপ একটি গবেষণায় দেখা গেছে যে SARS-CoV-2 এর জন্য অ্যাবটের পরীক্ষার সামগ্রিক সংবেদনশীলতা এবং নির্দিষ্টতা যথাক্রমে ৯৩% এবং ১০০%, CDC এর ল্যাবরেটরি-নির্ধারিত অ্যাস (LDA) এর তুলনায়। ১১. অ্যাবট SARS-CoV-2 সনাক্তকরণ ব্যবস্থা N এবং RdRp জিনের একযোগে সম্মিলিত সনাক্তকরণের উপর ভিত্তি করে তৈরি, কারণ উভয় জিনই বেশি সংবেদনশীল, মিথ্যা নেতিবাচকতা কমিয়ে দেয়। ১২. অস্ট্রিয়ার ভিয়েনায় করা একটি গবেষণায় আরও দেখা গেছে যে বৃহৎ নিষ্কাশন নমুনার পরিমাণ এবং সনাক্তকরণ ইলুয়েন্টের পরিমাণ তরলীকরণের প্রভাব কমিয়ে দেয় এবং সনাক্তকরণের দক্ষতা বৃদ্ধি করে। সুতরাং, SARS-CoV-2 পরীক্ষার জন্য অ্যাবটের নিখুঁত মিলটি এমন একটি প্ল্যাটফর্ম সনাক্তকরণ সিস্টেমের সাথে যুক্ত হতে পারে যা একই সাথে সম্মিলিত জিন সনাক্ত করে, প্রচুর সংখ্যক নমুনা (0.5 মিলি) বের করে এবং প্রচুর পরিমাণে ইলুয়েন্ট (40 µl) ব্যবহার করে।
আমাদের ফলাফলে আরও দেখা গেছে যে ডান জেনেটিক পরীক্ষার সনাক্তকরণ কর্মক্ষমতা প্রায় CRS-এর মতোই ছিল। এটি চীনের হুয়ানান-এর আনহুই বিশ্ববিদ্যালয়ে পরিচালিত একটি গবেষণা14 এবং প্রস্তুতকারকের 100% ইতিবাচক একমত দাবির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। ধারাবাহিক ফলাফলের রিপোর্ট সত্ত্বেও, একই এলুয়েট পুনরায় পরীক্ষা করার পরে একটি নমুনা মিথ্যা নেতিবাচক ছিল, তবে অ্যাবট SARS-CoV-2 এবং Sansure Biotech nCoV-2019 পরীক্ষায় ইতিবাচক ছিল। এটি ইঙ্গিত দেয় যে বিভিন্ন ধরণের পরীক্ষায় ফলাফলের পরিবর্তনশীলতা থাকতে পারে। তা সত্ত্বেও, চীনে পরিচালিত গবেষণায়, ডান জিন পরীক্ষার ফলাফল তাদের ল্যাব-সংজ্ঞায়িত রেফারেন্স পরীক্ষার তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন ছিল (p < 0.05)। তা সত্ত্বেও, চীনে পরিচালিত গবেষণায়, ডান জিন পরীক্ষার ফলাফল তাদের ল্যাব-সংজ্ঞায়িত রেফারেন্স পরীক্ষার তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন ছিল (p < 0.05)। Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) от этогологодовании অ্যানালিজা তবে, চীনের একটি গবেষণায়, ডান জিনের বিশ্লেষণের ফলাফল তাদের পরীক্ষাগার রেফারেন্স বিশ্লেষণ থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা ছিল (p < 0.05)।然而,在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考室定义漏参考检测相<0.05)।然而，在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测牘的参考室定义的参考检测縭15 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p < 0,05) погений эталонным labораторным тестом. তবে, চীনে করা একটি গবেষণায়, ডানের জেনেটিক পরীক্ষার ফলাফল তার রেফারেন্স ল্যাবরেটরি পরীক্ষার তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন ছিল (p < 0.05)।এই অসঙ্গতি SARS-CoV-2 সনাক্তকরণের জন্য রেফারেন্স পরীক্ষার সংবেদনশীলতার কারণে হতে পারে এবং কারণ নির্ধারণের জন্য আরও গবেষণা গুরুত্বপূর্ণ হতে পারে।
এছাড়াও, আমাদের গবেষণায় CRS-এর সাথে SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষার তুলনামূলক কর্মক্ষমতা মূল্যায়ন করা হয়েছে, যা চমৎকার ইতিবাচক শতাংশ চুক্তি (PPA = 97.9%), নেতিবাচক শতাংশ চুক্তি (NPA = 100%), এবং লিঙ্গ অনুসারে সামগ্রিক শতাংশ চুক্তি (OPA) দেখিয়েছে। = 98.8%। কোহেনের কাপ্পা মানগুলি ভাল চুক্তি দেখিয়েছে (K = 0.975)। নেদারল্যান্ডস16 এবং চীন15-এর গবেষণায় ধারাবাহিক ফলাফল দেখানো হয়েছে। SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা হল 10 µl পরিবর্ধন/সনাক্তকরণ ইলুয়েট ব্যবহার করে একটি একক জিন (ORF1a/b) সনাক্তকরণ পরীক্ষা। আমাদের রেফারেন্স ফলাফলের সাথে ভাল পরিসংখ্যানগত চুক্তি থাকা সত্ত্বেও, বিশ্লেষণে মোট নমুনার দুটি ইতিবাচক নমুনা (1.22%) বাদ পড়েছে। রোগী এবং সম্প্রদায় উভয় স্তরেই সংক্রমণ গতিশীলতার জন্য এর বিশাল ক্লিনিকাল প্রভাব থাকতে পারে।
এই গবেষণায় অন্তর্ভুক্ত আরেকটি তুলনামূলক বিশ্লেষণ ছিল স্যানসিওর বায়োটেক nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) অ্যাসে; সামগ্রিক মিলের শতাংশ ছিল 96.3%। কোহেনের কাপ্পা মান দ্বারাও চুক্তির শক্তি নির্ধারণ করা হয়েছিল, যা ছিল 0.925, যা CRS-এর সাথে সম্পূর্ণ একমত হওয়ার ইঙ্গিত দেয়। আবার, আমাদের ফলাফল চীনের চাংশার সেন্ট্রাল সাউথ ইউনিভার্সিটি এবং চীনের লিউঝো শহরের লিউঝো পিপলস হাসপাতালের ক্লিনিক্যাল ল্যাবরেটরি বিভাগে পরিচালিত গবেষণার সাথে অভিন্ন। যদিও উপরের ভালো পরিসংখ্যানগত সামঞ্জস্য রেকর্ড করা হয়েছিল, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) দেখিয়েছে যে স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাসের ফলাফলে CRS (p < 0.005) এর তুলনায় পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য রয়েছে। যদিও উপরের ভালো পরিসংখ্যানগত সামঞ্জস্য রেকর্ড করা হয়েছিল, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) দেখিয়েছে যে স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাসের ফলাফলে CRS (p < 0.005) এর তুলনায় পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য রয়েছে। Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий хи-квадрат) показал, что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p < 0,005)। যদিও উপরে ভাল পরিসংখ্যানগত চুক্তি রেকর্ড করা হয়েছিল, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) দেখিয়েছে যে স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাসের ফলাফলে CRS (p < 0.005) এর তুলনায় পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য রয়েছে।尽管记录了上述良好的统计一致性,但卡方检验（MacNemar 检验）表明,সানসুর বায়োটেক 检浞SCR相比具有统计学显着差异（p <0.005）।尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 , 但 检验 （（macnemar 检验 表明 , , sansure 丞 济s 最 বায়োটেক相比 具有 显着 （（（（p <0.005）।।। Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) покачистузие статистическое соответствие разницу (p < 0,005) между анализом Sansure Biotech এবং CRS। উপরে উল্লিখিত ভালো পরিসংখ্যানগত সমঝোতা সত্ত্বেও, চি-স্কয়ার পরীক্ষা (ম্যাকনেমার পরীক্ষা) স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাস এবং সিআরএসের মধ্যে একটি পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য (p < 0.005) দেখিয়েছে।সিআরএসের তুলনায় ছয়টি নমুনা (৩.৬৬%) মিথ্যা নেতিবাচক পাওয়া গেছে (পরিপূরক সারণী ১); এটি খুবই গুরুত্বপূর্ণ, বিশেষ করে ভাইরাস সংক্রমণের গতিশীলতার কারণে। উপরের তথ্যগুলিও এই কম সনাক্তকরণ হারকে সমর্থন করে15।
এই গবেষণায়, প্রতিটি পরীক্ষা এবং সংশ্লিষ্ট প্ল্যাটফর্মের জন্য Ct মান নির্ধারণ করা হয়েছিল, Abbott SARS-CoV-2 পরীক্ষায় সর্বনিম্ন গড় Ct মান রিপোর্ট করা হয়েছিল। এই ফলাফলটি SARS-CoV-2 সনাক্তকরণের জন্য Abbott-এর যুগপত সম্মিলিত জেনেটিক পরীক্ষা ব্যবস্থার সাথে সম্পর্কিত হতে পারে। অতএব, চিত্র 1 অনুসারে, Abbott SARS-CoV-2 ফলাফলের 87.6% ফলাফলের Ct মান 20 এর নিচে ছিল। মাত্র অল্প সংখ্যক নমুনা ফলাফল (12.4%) 20-30 পরিসরে ছিল। 30 এর উপরে Ct মান রেকর্ড করা হয়নি। Abbott-এর SARS-CoV-2 প্যানেল জেনেটিক পরীক্ষার ফর্ম্যাট ব্যবহারের পাশাপাশি, এই ফলাফল নিম্ন সনাক্তকরণ সীমা (32.5 RNA কপি/mL)18 এর সাথে সম্পর্কিত হতে পারে, যা কোম্পানির নিম্ন সীমা 100 RNA কপি/mL. mL)19 এর চেয়ে তিনগুণ কম।
এই গবেষণায় কিছু সীমাবদ্ধতা রয়েছে: প্রথমত, সম্পদের অভাবে আমাদের কাছে স্ট্যান্ডার্ড/রেফারেন্স পদ্ধতি [যেমন ভাইরাল লোড বা অন্যান্য ল্যাবরেটরি পরীক্ষা (LDA)] নেই। দ্বিতীয়ত, এই গবেষণায় ব্যবহৃত সমস্ত নমুনা ছিল ন্যাসোফ্যারিঞ্জিয়াল সোয়াব, যদিও ফলাফল অন্যান্য ধরণের নমুনার ক্ষেত্রে প্রযোজ্য ছিল না এবং তৃতীয়ত, আমাদের নমুনার আকার ছোট ছিল।
এই গবেষণায় ন্যাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা ব্যবহার করে SARS-CoV-2 এর জন্য চারটি rRT-PCR পরীক্ষার কার্যকারিতা তুলনা করা হয়েছে। স্যানসিওর বায়োটেক পরীক্ষা বাদে সমস্ত সনাক্তকরণ পরীক্ষা প্রায় তুলনীয় ছিল। এছাড়াও, স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাসে সিআরএসের তুলনায় কম পজিটিভিটি হার চিহ্নিত করা হয়েছে (p < 0.05)। এছাড়াও, স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাসে সিআরএসের তুলনায় কম পজিটিভিটি হার চিহ্নিত করা হয়েছে (p < 0.05)। Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05)। এছাড়াও, স্যানসিওর বায়োটেক পরীক্ষায় সিআরএসের তুলনায় ইতিবাচক ফলাফলের শতাংশ কম দেখানো হয়েছে (p < 0.05)।此外,与CRS 相比,সানসুর বায়োটেক 检测的阳性率较低(p <0.05)।此外,与CRS 相比,সানসুর বায়োটেক 检测的阳性率较低(p <0.05)। Кроме того, анализ sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05)। এছাড়াও, স্যানসিওর বায়োটেক অ্যাসে সিআরএসের তুলনায় কম পজিটিভিটি হার ছিল (p < 0.05)।PPA, NPA এবং সামগ্রিক চুক্তির Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) বিশ্লেষণ ৯৩.৫% ছাড়িয়ে গেছে, যেখানে Cohen Kappa-এর চুক্তির মান ০.৯২৫। পরিশেষে, ইথিওপিয়ায় ব্যবহারের জন্য Sansure Biotech Assay (RUO) এর আরও বৈধতা প্রয়োজন এবং পৃথক নির্মাতাদের দাবি মূল্যায়নের জন্য অতিরিক্ত গবেষণা বিবেচনা করা উচিত।
তুলনামূলক গবেষণা নকশা আদ্দিস আবাবার চারটি স্বাস্থ্যসেবা কেন্দ্র, একা কোটেবে হাসপাতাল, মিলেনিয়াম চার্চ ট্রিটমেন্ট সেন্টার, জেউডিটু মেমোরিয়াল হাসপাতাল এবং সেন্ট পিটার্স টিউবারকুলোসিস স্পেশালিস্ট হাসপাতালে পরিচালিত হয়েছিল। তথ্য সংগ্রহ করা হয়েছিল ১ থেকে ৩১ ডিসেম্বর, ২০২০ এর মধ্যে। এই গবেষণার জন্য চিকিৎসা সুবিধাগুলি উদ্দেশ্যমূলকভাবে তাদের উচ্চ সংখ্যক মামলা এবং শহরের প্রধান চিকিৎসা কেন্দ্রগুলির প্রাপ্যতার উপর ভিত্তি করে নির্বাচন করা হয়েছিল। একইভাবে, NAAT রিএজেন্ট নির্মাতাদের সুপারিশ অনুসারে ABI 7500 এবং Abbott m2000 রিয়েল-টাইম PCR যন্ত্র সহ যন্ত্রগুলি নির্বাচন করা হয়েছিল এবং এই গবেষণার জন্য চারটি PCR সনাক্তকরণ কিট নির্বাচন করা হয়েছিল, কারণ ইথিওপিয়ার বেশিরভাগ পরীক্ষাগার কমপক্ষে চারটি ব্যবহার করেছিল। জিন পরীক্ষা, Abbott SARS-CoV-2 পরীক্ষা, Sansure Biotech পরীক্ষা এবং SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা অধ্যয়নের সময় সম্পাদিত হয়েছিল)।
১ থেকে ৩০ ডিসেম্বর ২০২০ পর্যন্ত, EPHI-তে রেফার করা COVID-19-এর জন্য তদন্তাধীন ব্যক্তিদের কাছ থেকে ৩ মিলি ভাইরাল ট্রান্সপোর্ট মিডিয়াম (VTM) (মিরাক্লিন টেকনোলজি, শেনজেন, চীন) ব্যবহার করে SARS-CoV-2 পরীক্ষা করা হয়েছিল। প্রশিক্ষিত নমুনা সংগ্রহকারীরা নাসোফ্যারিঞ্জিয়াল নমুনা সংগ্রহ করেছিলেন এবং ট্রিপল প্যাকে EPHI-তে পাঠানো হয়েছিল। নিউক্লিক অ্যাসিড বিচ্ছিন্নকরণের আগে, প্রতিটি নমুনাকে একটি অনন্য শনাক্তকরণ নম্বর দেওয়া হয়। ম্যানুয়াল এবং স্বয়ংক্রিয় নিষ্কাশন পদ্ধতি ব্যবহার করে প্রতিটি নমুনা থেকে নিষ্কাশন করা হয়। সুতরাং, Abbott m2000 স্বয়ংক্রিয়ভাবে নিষ্কাশনের জন্য, প্রতিটি নমুনা থেকে ১.৩ মিলি (০.৮ মিলি ডেড ভলিউম এবং ০.৫ মিলি এক্সট্রাকশন ইনলেট ভলিউম সহ) নমুনা বের করা হয়েছিল এবং Abbott DNA নমুনা প্রস্তুতি ব্যবস্থা (Abbott Molecular Inc. des Plaines, IL, USA) এর মাধ্যমে পাস করা হয়েছিল। ) রিয়েল টাইমে SARS-CoV-2 (EUA) এর দুটি রাউন্ডের সামগ্রিক প্রক্রিয়া (পুনরুদ্ধার এবং সনাক্তকরণ) -এ 96টি [92টি নমুনা, দুটি সনাক্তকরণ নিয়ন্ত্রণ এবং দুটি নন-টেমপ্লেট নিয়ন্ত্রণ (NTC)] এর একটি ব্যাচ অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল। মাইনিং। একইভাবে, ম্যানুয়াল নিষ্কাশনের জন্য, একই নমুনা ব্যবহার করুন (স্বয়ংক্রিয় নিষ্কাশন এবং আবিষ্কারের জন্য)। এইভাবে, পুরো প্রক্রিয়া জুড়ে, QIAamp ভাইরাল RNA মিনি কিট (QIAGEN GmbH, হিলডেন, জার্মানি) ব্যবহার করে 24টি ব্যাচে (20টি নমুনা, দুটি অ্যাসে কন্ট্রোল এবং দুটি NTC সহ) 140 µl নমুনা আলাদা করা হয়েছিল এবং নয়টি রাউন্ডে নিষ্কাশন করা হয়েছিল। SARS-CoV-2 BGI অ্যাসে, ডান জিন অ্যাসে এবং স্যানসুর বায়োটেক অ্যাসে ব্যবহার করে ABI 7500 থার্মাল সাইক্লার ব্যবহার করে ম্যানুয়ালভাবে নিষ্কাশিত ইলুয়েটগুলিকে প্রশস্ত করা হয়েছিল এবং সনাক্ত করা হয়েছিল।
SARS-CoV-2 ভাইরাল RNA-এর স্বয়ংক্রিয় বিচ্ছিন্নতা এবং পরিশোধন অ্যাবট ডিএনএ নমুনা প্রস্তুতি বিকারক ব্যবহার করে চৌম্বকীয় পুঁতির নীতি অনুসরণ করে। প্রোটিনকে বিকৃত করে RNase নিষ্ক্রিয় করার জন্য গুয়ানিডিন আইসোথিওসায়ানেট ধারণকারী একটি ডিটারজেন্ট ব্যবহার করে নমুনা নিষ্ক্রিয়করণ এবং ভাইরাল কণার দ্রাব্যকরণ করা হয়। এরপর সিলিকা ব্যবহার করে কঠিন পর্যায় পৃথকীকরণের মাধ্যমে RNA-কে প্রোটিন থেকে আলাদা করা হয়, অর্থাৎ গুয়ানিডিনিয়াম লবণ এবং লিসিস বাফারের ক্ষারীয় pH নিউক্লিক অ্যাসিডকে সিলিকার সাথে আবদ্ধ করতে সাহায্য করে (SiO2)। ধোয়ার ধাপটি অবশিষ্ট প্রোটিন এবং ধ্বংসাবশেষ অপসারণ করে একটি পরিষ্কার দ্রবণ তৈরি করে। যন্ত্রের চৌম্বক ক্ষেত্র ব্যবহার করে সিলিকা-ভিত্তিক মাইক্রোকণা থেকে স্বচ্ছ RNA বিচ্ছিন্ন করা হয়20,21। অন্যদিকে, চৌম্বকীয় স্ট্যান্ডের পরিবর্তে সেন্ট্রিফিউগেশন ব্যবহার করে স্পিন কলাম পদ্ধতিতে RNA-এর ম্যানুয়াল বিচ্ছিন্নতা এবং পরিশোধন করা হয় এবং ইলুয়েন্ট থেকে মাইক্রোকণা পৃথক করা হয়।
অ্যাবট রিয়েল-টাইম SARS-CoV-2 সনাক্তকরণ পরীক্ষা (অ্যাবট মলিকুলার, ইনকর্পোরেটেড) প্রস্তুতকারকের নির্দেশ অনুসারে করা হয়েছিল, যা WHO এবং FDA থেকে EUA19,22 পেয়েছে। এই প্রোটোকলে, নিষ্কাশনের আগে নমুনা নিষ্ক্রিয়করণ 56 °C তাপমাত্রায় 30 মিনিটের জন্য একটি জল স্নানে সঞ্চালিত হয়েছিল। ভাইরাস নিষ্ক্রিয়করণের পরে, অ্যাবট m2000 DNA নমুনা প্রস্তুতি ব্যবস্থা ব্যবহার করে 0.5 মিলি VTM থেকে অ্যাবট m2000 SP যন্ত্রে নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন করা হয়েছিল। প্রস্তুতকারকের মতে। অ্যাবট m2000 RT-PCR যন্ত্র ব্যবহার করে পরিবর্ধন এবং সনাক্তকরণ করা হয়েছিল, এবং অভ্যন্তরীণ নিয়ন্ত্রণ লক্ষ্যবস্তু এবং সনাক্তকরণের জন্য RdRp এবং N জিনের জন্য দ্বৈত সনাক্তকরণ করা হয়েছিল, যা উভয় পরিবর্ধন পণ্যের একযোগে সনাক্তকরণের অনুমতি দেয় 19।
এই কিটের অ্যামপ্লিফিকেশন সনাক্তকরণ পদ্ধতিটি এক-পদক্ষেপ RT-PCR প্রযুক্তির উপর ভিত্তি করে তৈরি। লক্ষ্য অঞ্চলের অ্যামপ্লিফিকেশন সনাক্তকরণের জন্য ডান জিন টেকনোলজি দ্বারা ORF1a/b এবং N জিনগুলিকে সংরক্ষিত অঞ্চল হিসাবে নির্বাচিত করা হয়েছিল। নমুনাগুলিতে SARS-CoV-2 RNA সনাক্ত করার জন্য নির্দিষ্ট প্রাইমার এবং ফ্লুরোসেন্ট প্রোব (FAM লেবেলযুক্ত N জিন প্রোব, VIC লেবেলযুক্ত ORF1a/b প্রোব) ডিজাইন করা হয়েছে। চূড়ান্ত ইলুয়েন্ট এবং মাস্টার মিশ্রণগুলি 20 µl মাস্টার মিশ্রণে 5 µl ইলুয়েন্ট যোগ করে 25 µl এর চূড়ান্ত আয়তনে প্রস্তুত করা হয়েছিল। ABI 750024 রিয়েল-টাইম PCR যন্ত্রে একযোগে অ্যামপ্লিফিকেশন এবং সনাক্তকরণ করা হয়েছিল।
স্যানসিওর বায়োটেক nCoV-2019 নিউক্লিক অ্যাসিড ডায়াগনস্টিক কিট (ফ্লুরোসেন্ট পিসিআর সনাক্তকরণ) ব্যবহার করে ORF1a/b এবং N জিন সনাক্ত করা হয়েছিল। ORF1a/b অঞ্চলের জন্য FAM চ্যানেল এবং N জিনের জন্য ROX চ্যানেল নির্বাচন করে প্রতিটি লক্ষ্য জিনের জন্য নির্দিষ্ট প্রোব প্রস্তুত করুন। এই অ্যাসে কিটে, এলুয়েন্ট এবং মাস্টার মিক্স রিএজেন্টগুলি নিম্নরূপ যুক্ত করা হয়েছে: সনাক্তকরণ/পরিবর্ধনের জন্য 30 µl মাস্টার মিক্স রিএজেন্ট এবং 20 µl এলুটেড নমুনা প্রস্তুত করুন। প্রশস্তকরণ/সনাক্তকরণের জন্য রিয়েল-টাইম পিসিআর ABI 750025 ব্যবহার করা হয়েছিল।
SARS-CoV-2 BGI পরীক্ষা হল COVID-19 রোগ নির্ণয়ের জন্য একটি ফ্লুরোসেন্ট রিয়েল-টাইম rRT-PCR কিট। লক্ষ্য অঞ্চলটি SARS-CoV-2 জিনোমের ORF1a/b অঞ্চলে অবস্থিত, যা একটি একক জিন সনাক্তকরণ পদ্ধতি। এছাড়াও, মানব গৃহস্থালি জিন β-অ্যাক্টিন একটি অভ্যন্তরীণভাবে নিয়ন্ত্রিত লক্ষ্য জিন। একটি ওয়েল প্লেটে 20 µl মাস্টার মিক্স রিএজেন্ট এবং 10 µl নিষ্কাশিত RNA নমুনা মিশিয়ে মাস্টার মিশ্রণটি প্রস্তুত করা হয়। পরিবর্ধন এবং সনাক্তকরণের জন্য একটি ABI 7500 ফ্লুরোসেন্ট পরিমাণগত রিয়েল-টাইম PCR যন্ত্র ব্যবহার করা হয়েছিল। সমস্ত নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন, প্রতিটি পরীক্ষার জন্য PCR রান শর্তাবলী এবং ফলাফলের ব্যাখ্যা সংশ্লিষ্ট নির্মাতার নির্দেশাবলী অনুসারে সম্পাদিত হয়েছিল (সারণী 3)।
এই তুলনামূলক বিশ্লেষণে, আমরা চারটি বিশ্লেষণের জন্য শতাংশ চুক্তি (ধনাত্মক, নেতিবাচক এবং সামগ্রিক) এবং অন্যান্য তুলনামূলক পরামিতি নির্ধারণের জন্য রেফারেন্স স্ট্যান্ডার্ড পদ্ধতি ব্যবহার করিনি। প্রতিটি পরীক্ষার তুলনা CRS-এর সাথে করা হয়েছিল, এই গবেষণায় CRS "যেকোনো ইতিবাচক" নিয়ম দ্বারা সেট করা হয়েছিল এবং ফলাফল নির্ধারণ করা হয়েছিল, একটি একক পরীক্ষার মাধ্যমে নয়, আমরা কমপক্ষে দুটি মিলিত পরীক্ষার ফলাফল ব্যবহার করেছি। এছাড়াও, COVID-19 সংক্রমণের ক্ষেত্রে, মিথ্যা নেতিবাচক ফলাফল মিথ্যা ইতিবাচক ফলাফলের চেয়ে বেশি বিপজ্জনক। অতএব, CRS ফলাফল থেকে যতটা সম্ভব সঠিকভাবে "ধনাত্মক" বলতে, কমপক্ষে দুটি পরীক্ষা পরীক্ষা ইতিবাচক হতে হবে, যার অর্থ হল EUA পরীক্ষা থেকে কমপক্ষে একটি ইতিবাচক ফলাফল আসার সম্ভাবনা রয়েছে। সুতরাং, চারটি পরীক্ষার ফলাফলের মধ্যে, একই ফলাফল প্রদানকারী দুই বা ততোধিক পরীক্ষার ফলাফলকে সত্য ইতিবাচক বা নেতিবাচক হিসাবে বিবেচনা করা হয়18,27।
স্ট্রাকচার্ড ডেটা এক্সট্রাকশন ফর্ম ব্যবহার করে ডেটা সংগ্রহ করা হয়েছিল, এক্সেল পরিসংখ্যানগত সফ্টওয়্যার এবং বর্ণনামূলক পরিসংখ্যানের জন্য SPSS সংস্করণ 23.0 ব্যবহার করে ডেটা এন্ট্রি এবং বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। ধনাত্মক, ঋণাত্মক এবং সামগ্রিক শতাংশ চুক্তি বিশ্লেষণ করা হয়েছিল এবং CRS-এর সাথে প্রতিটি পদ্ধতির চুক্তির মাত্রা নির্ধারণের জন্য একটি কাপ্পা স্কোর ব্যবহার করা হয়েছিল। কাপ্পা মানগুলি নিম্নরূপ ব্যাখ্যা করা হয়েছে: হালকা চুক্তির জন্য 0.01 থেকে 0.20, সাধারণ চুক্তির জন্য 0.21 থেকে 0.40, মাঝারি চুক্তির জন্য 0.41-0.60, প্রধান চুক্তির জন্য 0.61-0.80 এবং সম্পূর্ণ চুক্তির জন্য 0.81-0.9928।
আদ্দিস আবাবা বিশ্ববিদ্যালয় থেকে নীতিগত ছাড়পত্র পাওয়া গেছে এবং এই গবেষণার জন্য সমস্ত পরীক্ষামূলক প্রোটোকল ইথিওপিয়ান পাবলিক হেলথ ইনস্টিটিউটের বৈজ্ঞানিক নীতিশাস্ত্র পর্যালোচনা বোর্ড কর্তৃক অনুমোদিত হয়েছে। EPHI নীতিশাস্ত্র লাইসেন্সের রেফারেন্স নম্বর হল EPHI/IRB-279-2020। সমস্ত পদ্ধতি COVID-19 চিকিৎসার জন্য ইথিওপিয়ান জাতীয় ব্যাপক নির্দেশিকাগুলির সুপারিশ এবং বিধান অনুসারে প্রয়োগ করা হয়েছে। এছাড়াও, গবেষণায় অংশগ্রহণের আগে সমস্ত অধ্যয়ন অংশগ্রহণকারীদের কাছ থেকে লিখিত অবহিত সম্মতি নেওয়া হয়েছিল।
এই গবেষণায় প্রাপ্ত বা বিশ্লেষণ করা সমস্ত তথ্য এই প্রকাশিত নিবন্ধে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে। যুক্তিসঙ্গত অনুরোধের ভিত্তিতে এই গবেষণার ফলাফল সমর্থনকারী তথ্য সংশ্লিষ্ট লেখকের কাছ থেকে পাওয়া যাবে।
বিশ্ব স্বাস্থ্য সংস্থা। COVID-19 এর জন্য ল্যাবরেটরি পরীক্ষার কৌশলগুলির জন্য সুপারিশ: অন্তর্বর্তীকালীন নির্দেশিকা, ২১ মার্চ, ২০২০ নং WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020)।
মৌলিউ, ডিএস, প্যান্টাজোপোলোস, আই. এবং গৌরগোলিয়ানিস, কেআই জরুরি বিভাগে কোভিড-১৯ স্মার্ট ডায়াগনসিস: অল-ইন-প্র্যাকটিস। মৌলিউ, ডিএস, প্যান্টাজোপোলোস, আই. এবং গৌরগোলিয়ানিস, কেআই জরুরি বিভাগে কোভিড-১৯ স্মার্ট ডায়াগনসিস: অল-ইন-প্র্যাকটিস।মুলিউ, ডিএস, প্যান্টাজোপোলোস, আই. এবং গুরগুলিয়ানিস, কেআই। জরুরি বিভাগে কোভিড-১৯ এর বুদ্ধিমান রোগ নির্ণয়: বাস্তবে সবকিছু।মুলিউ ডিএস, প্যান্টাজোপোলোস আই. এবং গুরগুলিয়ানিস কেআই জরুরি বিভাগে কোভিড-১৯ এর বুদ্ধিমান রোগ নির্ণয়: অনুশীলনে এন্ড-টু-এন্ড ইন্টিগ্রেশন। বিশেষজ্ঞ রেভারেন্ড রেসপির। মেডিসিন। ৩, ২৬৩–২৭২ (২০২২)।
মিচেল, এসএল এবং সেন্ট জর্জ, কে। COVID19 ID NOW EUA অ্যাসের মূল্যায়ন। মিচেল, এসএল এবং সেন্ট জর্জ, কে। COVID19 ID NOW EUA অ্যাসের মূল্যায়ন।মিচেল, এসএল এবং সেন্ট জর্জ, কে। COVID19 ID NOW EUA অ্যাসের মূল্যায়ন।মিচেল এসএল এবং সেন্ট জর্জ কে. COVID19 ID NOW EUA অ্যাসের মূল্যায়ন। জে. ক্লিনিক্যাল। ভাইরাস। 128, 104429। https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020)।
WHO। সন্দেহভাজন মানব রোগে করোনাভাইরাস রোগ 2019 (COVID-19) এর পরীক্ষাগার সনাক্তকরণ। https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (অ্যাক্সেস করা হয়েছে 15 আগস্ট 2020) (WHO, 2020)।
উদুগামা, বি. প্রমুখ। কোভিড-১৯ রোগ নির্ণয়: রোগ এবং পরীক্ষার সরঞ্জাম। ACS ন্যানো 14(4), 3822–3835 (2020)।
সৈয়দ এস. প্রমুখ। পূর্ব, মধ্য ও দক্ষিণ আফ্রিকার রোগ বিশেষজ্ঞ কলেজ প্রতিষ্ঠা - মধ্যপ্রাচ্য ও দক্ষিণ আফ্রিকার আঞ্চলিক রোগবিদ্যা স্কুল। আফ্রিকা। জে. ল্যাব। মেডিসিন। 9(1), 1-8 (2020)।
ইথিওপিয়ান ইনস্টিটিউট অফ পাবলিক হেলথ, ফেডারেল মিনিস্ট্রি অফ হেলথ। কোভিড-১৯ এর ল্যাবরেটরি ডায়াগনসিসের জন্য অন্তর্বর্তীকালীন জাতীয় কৌশল এবং নির্দেশিকা। https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (অ্যাক্সেস করা হয়েছে ১২ আগস্ট ২০২০) (EPHI, ২০২০)।
ওলোশিন, এস., প্যাটেল, এন. এবং কেসেলহেইম, এএস SARS-CoV-2 সংক্রমণের চ্যালেঞ্জ এবং প্রভাবের জন্য মিথ্যা নেতিবাচক পরীক্ষা। ওলোশিন, এস., প্যাটেল, এন. এবং কেসেলহেইম, এএস SARS-CoV-2 সংক্রমণের চ্যালেঞ্জ এবং প্রভাবের জন্য মিথ্যা নেতিবাচক পরীক্ষা।ভোলোশিন এস., প্যাটেল এন. এবং কেসেলহেইম এএস SARS-CoV-2 সংক্রমণ এবং তাদের পরিণতির জন্য মিথ্যা-নেতিবাচক পরীক্ষা।ভোলোশিন এস., প্যাটেল এন. এবং কেসেলহেইম এএস SARS-CoV-2 সংক্রমণের উস্কানি এবং প্রভাবের জন্য মিথ্যা-নেতিবাচক পরীক্ষা। এন. ইঞ্জিনিয়ার জে. মেডিসিন। 383(6), e38 (2020)।
মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগোলিয়ানিস, কেআই মিথ্যা-পজিটিভ এবং মিথ্যা-নেগেটিভ COVID-19 কেস: শ্বাসযন্ত্র প্রতিরোধ এবং ব্যবস্থাপনা কৌশল, টিকাকরণ এবং আরও দৃষ্টিভঙ্গি। মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগোলিয়ানিস, কেআই মিথ্যা-পজিটিভ এবং মিথ্যা-নেগেটিভ COVID-19 কেস: শ্বাসযন্ত্র প্রতিরোধ এবং ব্যবস্থাপনা কৌশল, টিকাকরণ এবং আরও দৃষ্টিভঙ্গি। মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগৌলিয়ানিস, কেআই লোজনোপোলোজিট্যালনি এবং লোজনোটরিস্যাটেলনিয় স্লুচ্যাই কোভিড-১৯: রেসপিরাটোরনায়া প্রফিলাক্টিকা এবং স্ট্র্যাটেজি, ডালনেইশিয়ে পারস্পেকটিভ। মৌলিউ, ডিএস এবং গৌরগোলিয়ানিস, কেআই কোভিড-১৯ এর মিথ্যা পজিটিভ এবং মিথ্যা নেগেটিভ কেস: শ্বাসযন্ত্রের প্রতিরোধ এবং চিকিৎসার কৌশল, টিকাকরণ এবং ভবিষ্যতের পথ।মুলিউ, ডিএস এবং গুরগুলিয়ানিস, কেআই কোভিড-১৯ এর মিথ্যা-পজিটিভ এবং মিথ্যা-নেগেটিভ কেস: শ্বাসযন্ত্রের প্রতিরোধ এবং চিকিৎসার কৌশল, টিকাকরণ এবং ভবিষ্যতের পথ। বিশেষজ্ঞ রেভারেন্ড রেসপির। মেডিসিন। 15(8), 993–1002 (2021)।
মৌলিউ, ডিএস, ইওয়ানিস, পি. এবং কনস্টান্টিনোস, জি. জরুরি বিভাগে কোভিড-১৯ রোগ নির্ণয়: গাছ দেখা কিন্তু বন হারানো। মৌলিউ, ডিএস, ইওয়ানিস, পি. এবং কনস্টান্টিনোস, জি. জরুরি বিভাগে কোভিড-১৯ রোগ নির্ণয়: গাছ দেখা কিন্তু বন হারানো।মৌলিউ, ডিএস, ইওনিস, পি. এবং কনস্টান্টিনোস, জি. জরুরি বিভাগে কোভিড-১৯ রোগ নির্ণয়: গাছটি দেখুন, বন হারান।মুলিউ ডিএস, ইওনিস পি., এবং কনস্টান্টিনোস জি. জরুরি কক্ষে কোভিড-১৯ রোগ নির্ণয়: গাছের জন্য পর্যাপ্ত বন নেই। আবির্ভূত হওয়া। ঔষধ। জে. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022)।
ডেগলি-অ্যাঞ্জেলি, ই. প্রমুখ। অ্যাবট রিয়েলটাইম SARS-CoV-2 অ্যাসের বিশ্লেষণাত্মক এবং ক্লিনিক্যাল পারফরম্যান্সের বৈধতা এবং বৈধতা। জে. ক্লিনিক্যাল। ভাইরাস। 129, 104474। https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020)।
মোল্লাই, এইচআর, আফশার, এএ, কালান্তর-নেয়েস্তানাকি, ডি., ফজলালিপুর, এম. এবং আফলাতুনিয়ান, বি. প্রচলিত আরটি-পিসিআর দ্বারা ভাইরাস সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য কোভিড-১৯ এর বিভিন্ন জিনোম অঞ্চল থেকে পাঁচটি প্রাইমার সেটের তুলনা। মোল্লাই, এইচআর, আফশার, এএ, কালান্তর-নেয়েস্তানাকি, ডি., ফজলালিপুর, এম. এবং আফলাতুনিয়ান, বি. প্রচলিত আরটি-পিসিআর দ্বারা ভাইরাস সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য কোভিড-১৯ এর বিভিন্ন জিনোম অঞ্চল থেকে পাঁচটি প্রাইমার সেটের তুলনা।মোল্লাই, এইচআর, আফশার, এএ, কালান্তর-নেয়েস্তানাকি, ডি., ফজলালিপুর, এম. এবং আফলাতুনিয়ান, বি. প্রচলিত আরটি-পিসিআর দ্বারা ভাইরাল সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য কোভিড-১৯ জিনোমের বিভিন্ন অঞ্চল থেকে পাঁচটি সেট প্রাইমারের তুলনা। মোল্লাই, এইচআর, আফশার, এএ, কালান্তর-নেয়েস্তানাকি, ডি., ফজলালিপুর, এম. ও আফলাতুনিয়ান, বি. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组,用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染. মোল্লাই, এইচআর, আফশার, এএ, কালান্তর-নেয়েস্তানাকি, ডি., ফজলালিপুর, এম. এবং আফলাতুনিয়ান, বি. প্রচলিত আরটি-পিসিআর দ্বারা ভাইরাল সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য কোভিড-১৯ এর ৫টি ভিন্ন জেনেটিক অঞ্চলের তুলনা।মোল্লাই এইচআর, আফশার এএ, কালান্তর-নেয়েস্তানাকি ডি, ফজলালিপুর এম. এবং আফলাতুনিয়ান বি. প্রচলিত আরটি-পিসিআর দ্বারা ভাইরাল সংক্রমণ সনাক্তকরণের জন্য কোভিড-১৯ জিনোমের বিভিন্ন অঞ্চল থেকে পাঁচটি সেট প্রাইমারের তুলনা।ইরান। জে. মাইক্রোবায়োলজি। ১২(৩), ১৮৫ (২০২০)।
গোয়ার্ৎজার, আই. এট আল. SARS-CoV-2 জিনোম সিকোয়েন্স সনাক্তকরণের জন্য জাতীয় বহিরাগত মান মূল্যায়ন কর্মসূচির প্রাথমিক ফলাফল। জে. ক্লিনিক্যাল. ভাইরাস। ১২৯, ১০৪৫৩৭। https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020)।
ওয়াং, এম. প্রমুখ। গুরুতর তীব্র শ্বাসযন্ত্রের সিন্ড্রোম করোনাভাইরাসের জন্য পাঁচটি আরটি-পিসিআর কিটের কার্যকারিতার বিশ্লেষণাত্মক মূল্যায়ন 2. জে. ক্লিনিক্যাল. ল্যাবরেটরি. মলদ্বার. 35(1), e23643 (2021)।
ওয়াং বি. প্রমুখ। রিয়েল-টাইম পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (PCR) এর উপর ভিত্তি করে চীনে বাণিজ্যিকভাবে উপলব্ধ সাতটি SARS-CoV-2 RNA সনাক্তকরণ কিটের মূল্যায়ন। ক্লিনিক্যাল। রাসায়নিক। পরীক্ষাগার। ঔষধ। 58(9), e149–e153 (2020)।
ভ্যান ক্যাস্টেরেন, পিবি এবং অন্যান্যরা। সাতটি বাণিজ্যিক আরটি-পিসিআর কোভিড-১৯ ডায়াগনস্টিক কিটের তুলনা। জে. ক্লিনিক্যাল। ভাইরাস। ১২৮, ১০৪৪১২ (২০২০)।
লু, ইউ, প্রমুখ। SARS-CoV-2 নিউক্লিক অ্যাসিড সনাক্তকরণের জন্য দুটি PCR কিটের ডায়াগনস্টিক পারফরম্যান্সের তুলনা। জে. ক্লিনিক্যাল। ল্যাবরেটরি। মলদ্বার। 34(10), e23554 (2020)।
লেফার্ট, পিআর, ইত্যাদি। চারটি SARS-CoV-2 নিউক্লিক অ্যাসিড অ্যামপ্লিফিকেশন টেস্টিং (NAAT) প্ল্যাটফর্মের তুলনামূলক গবেষণায় দেখা গেছে যে রোগী এবং নমুনার ধরণের উপর নির্ভর করে ID NOW এর কর্মক্ষমতা উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস পেয়েছে। রোগ নির্ণয়। মাইক্রোবায়োলজি। ইনফেক্ট। ডিস। 99(1), 115200 (2021)।
অ্যাবট অণু। অ্যাবট রিয়েল-টাইম SARS-CoV-2 বিশ্লেষণ প্যাকেজ সন্নিবেশ। https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (আগস্ট ১০, ২০২০ অনুযায়ী) (২০২০)।
ক্লেইন, এস. এট আল। RT-qPCR এবং RT-LAMP দ্বারা দ্রুত বৃহৎ আকারের সনাক্তকরণের জন্য চৌম্বকীয় পুঁতি ব্যবহার করে SARS-CoV-2 RNA বিচ্ছিন্নকরণ। ভাইরাস 12(8), 863 (2020)।